Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTM1

H2AFJ, Histone H2A.J, humanhuman

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2AFJQ9BTM1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 GRAMD2B-219ENST00000544396 2822 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 KCTD7-202ENST00000443322 1160 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 NCAM1-AS1-201ENST00000526229 1081 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 NIPAL2-201ENST00000341166 4581 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 CMTM3-201ENST00000361909 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 IFFO1-212ENST00000619571 2724 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ALDOC-201ENST00000226253 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 MINDY2-202ENST00000450403 4820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 UNC13A-206ENST00000552293 5314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 SYDE2-202ENST00000341460 5512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 CKS1B-203ENST00000368439 912 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 UQCRQ-201ENST00000378665 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 HMGA1P5-201ENST00000412453 271 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 LINC01534-202ENST00000433232 554 ntTSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 KRBOX1-AS1-201ENST00000447834 2134 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ECEL1P2-202ENST00000465689 757 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 TMEM249-203ENST00000565365 975 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 JOSD2-204ENST00000598418 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 TLK2-202ENST00000343388 3227 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 CYP51A1P1-201ENST00000492267 1507 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 NDUFA10-214ENST00000620965 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 RAP1GAP-204ENST00000374761 3318 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 NTRK1-201ENST00000358660 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 UNC5D-204ENST00000420357 2966 ntTSL 5 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.06■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 TH-205ENST00000381175 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 AK1-203ENST00000373176 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ADGRD2-201ENST00000334810 3244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ORC5-201ENST00000297431 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 INGX-201ENST00000359239 846 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 AC013402.1-201ENST00000456999 561 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 TMEM220-AS1-201ENST00000579114 575 ntTSL 4 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 KCNQ2-218ENST00000629676 2399 ntTSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 KCNQ2-205ENST00000360480 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
H2AFJQ9BTM1 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms