Protein–RNA interactions for Protein: Q96QS3

ARX, Homeobox protein ARX, humanhuman

Predictions only

Length 562 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARXQ96QS3 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 ST3GAL3-219ENST00000372374 2170 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 ZBTB7B-201ENST00000292176 2129 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 AKNA-205ENST00000374079 2138 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 RABEPK-202ENST00000373538 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 SSC4D-201ENST00000275560 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 SERBP1-201ENST00000361219 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 DDX42-202ENST00000389924 3939 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 DOC2A-201ENST00000350119 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 CAMKV-205ENST00000467248 1688 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 NHLH2-201ENST00000320238 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 MCRIP2-211ENST00000629534 341 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 RBPMS-210ENST00000520191 1613 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 MAPK15-201ENST00000338033 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 NFKBIE-204ENST00000619360 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 PJA1-202ENST00000374571 2672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 AC036111.1-201ENST00000533973 1582 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 ADCY9-201ENST00000294016 7725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 ZNF668-202ENST00000394983 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 PDE3B-201ENST00000282096 6076 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 CD7-206ENST00000583376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 B3GALNT2-201ENST00000313984 1874 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 TBX2-201ENST00000240328 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 POMT2-201ENST00000261534 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 ILF2-202ENST00000368681 726 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 CHMP3-203ENST00000409225 1099 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 SMN1-203ENST00000503079 1219 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 KLHL21-206ENST00000610898 1945 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 DALRD3-205ENST00000440857 2014 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 DNAJC1-202ENST00000376980 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 STIM2-202ENST00000465503 3613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 LSR-214ENST00000621372 2274 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 FAM87B-201ENST00000326734 1947 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 UBN1-201ENST00000262376 6252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 TYROBP-209ENST00000589517 415 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 CD81-AS1-201ENST00000413483 1460 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 SLC35B1-201ENST00000240333 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 RUBCN-206ENST00000449205 1603 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 AC004408.2-201ENST00000623613 2777 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 INPP5J-203ENST00000401755 1751 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 KREMEN2-206ENST00000575885 1798 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 FKRP-202ENST00000391909 2801 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 PCSK7-201ENST00000320934 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 GLDN-201ENST00000335449 4971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 AC079031.1-201ENST00000542627 1035 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ARXQ96QS3 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms