Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q06

PLIN4, Perilipin-4, humanhuman

Predictions only

Length 1,357 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLIN4Q96Q06 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 MEF2B-202ENST00000409447 1297 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 NUP50-AS1-201ENST00000426282 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 ATPIF1-202ENST00000465645 1855 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 SYNGR2-202ENST00000585591 949 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 SPHK2-211ENST00000600537 2136 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 KIF1BP-201ENST00000361983 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 ABCB9-202ENST00000344275 2394 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 ADGRB1-202ENST00000517894 6241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 AC104819.1-201ENST00000504587 486 ntBASIC21.27■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 GGT2-201ENST00000401924 2366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 TMEM79-203ENST00000405535 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PLIN4Q96Q06 AC098818.2-201ENST00000564925 2320 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 MYC-201ENST00000259523 2042 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 KCNQ5-208ENST00000414165 6236 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 TPD52-209ENST00000518937 2856 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 SLC38A10-201ENST00000288439 2708 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 AC093503.3-201ENST00000624917 2352 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 TEX13A-201ENST00000600991 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 CENPX-201ENST00000306704 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 PNN-202ENST00000553331 656 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 C5orf47-201ENST00000340147 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 BAALC-203ENST00000309982 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 BACE2-202ENST00000330333 2993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 PLIN5-201ENST00000381848 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 CPNE7-201ENST00000268720 2657 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PLIN4Q96Q06 DOC2A-208ENST00000564944 1782 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 11.4 ms