Protein–RNA interactions for Protein: Q96PX6

CCDC85A, Coiled-coil domain-containing protein 85A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC85AQ96PX6 AP2S1-204ENST00000597020 707 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 PGM1-205ENST00000540265 2345 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
CCDC85AQ96PX6 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 WDR88-202ENST00000361680 1835 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 CRB2-202ENST00000373631 5550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 ASMTL-201ENST00000381317 2027 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 AC008105.1-201ENST00000587534 2003 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 CHCHD1-201ENST00000372833 835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 KRT18P31-201ENST00000506277 1292 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 DMWD-201ENST00000270223 3305 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 RMND5B-201ENST00000313386 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 HMCES-201ENST00000383463 2515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 PAFAH1B2-202ENST00000419197 2517 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 TUBA4A-202ENST00000392088 2499 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 ADAMTS19-205ENST00000638972 5089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 RBFOX1-204ENST00000422070 1684 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 MARK2-202ENST00000361128 3004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 SLC27A1-204ENST00000598424 2681 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 DMRT2-201ENST00000259622 2459 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 KRTAP5-6-201ENST00000382160 561 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 MOBP-204ENST00000420739 940 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 NDUFA6-204ENST00000617763 1183 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 CD209-210ENST00000601951 1439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 STX17-212ENST00000534052 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 EPB41L4B-201ENST00000374557 4006 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 NAT16-201ENST00000300303 2935 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 C6orf15-201ENST00000259870 1140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 MRPL43-203ENST00000318364 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 MRPL43-204ENST00000342071 894 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 SFTPD-201ENST00000372292 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
CCDC85AQ96PX6 AC009078.2-202ENST00000463353 338 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms