Protein–RNA interactions for Protein: Q96PU9

ODF3, Outer dense fiber protein 3, humanhuman

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Length 254 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ODF3Q96PU9 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 IL15-201ENST00000296545 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.61□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 SLC37A2-203ENST00000403796 2910 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 ITGB5-201ENST00000296181 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 ANKRD9-201ENST00000286918 6727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 NME1-202ENST00000336097 986 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 NME1-203ENST00000393196 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 LTB-210ENST00000429299 897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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ODF3Q96PU9 MNT-208ENST00000575394 606 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 AC097641.1-201ENST00000580671 588 ntTSL 4 BASIC13.6□□□□□ -0.23
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ODF3Q96PU9 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 RPS6KA1-203ENST00000374166 3131 ntTSL 5 BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
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ODF3Q96PU9 CRHR2-207ENST00000471646 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.6□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC13.6□□□□□ -0.23
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ODF3Q96PU9 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 UBL5-202ENST00000586895 432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 AP006294.2-201ENST00000641667 209 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
ODF3Q96PU9 PIGH-201ENST00000216452 1420 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF3Q96PU9 SLC35E2-201ENST00000246421 1430 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
ODF3Q96PU9 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
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