Protein–RNA interactions for Protein: Q96PL1

SCGB3A2, Secretoglobin family 3A member 2, humanhuman

Predictions only

Length 93 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCGB3A2Q96PL1 PRELID3A-202ENST00000440960 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 GOLGA7-204ENST00000520817 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 MYBL2-202ENST00000396863 2704 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 TWIST2-202ENST00000612363 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 BCAP29-202ENST00000379117 1946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 PITX3-201ENST00000370002 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 PDE9A-206ENST00000380328 1875 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 RND2-202ENST00000587250 4147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 DDHD2-201ENST00000397166 4921 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 RNH1-205ENST00000397615 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 GP9-201ENST00000307395 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 VMO1-201ENST00000328739 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 RASGRP2-209ENST00000394429 453 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 HAGLROS-201ENST00000426615 1121 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 AL356020.1-201ENST00000554235 1076 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 CYB561-214ENST00000582034 1193 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 GIPR-202ENST00000304207 1432 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 RHBDL1-201ENST00000219551 1560 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 C19orf84-202ENST00000574814 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 ZNF326-202ENST00000361911 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 GPR83-202ENST00000539203 1909 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 ANKRD29-201ENST00000322980 1658 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 AC069185.1-201ENST00000531395 811 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 PPP1R14A-205ENST00000591585 949 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SLC35A2-211ENST00000634461 533 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 MEGF6-201ENST00000294599 4501 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 VANGL2-201ENST00000368061 5340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SAAL1-204ENST00000529318 1503 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 KRT81-202ENST00000615839 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 KLHDC9-201ENST00000368011 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 TMEM230-206ENST00000379283 1660 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 MEF2A-204ENST00000557785 2854 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 SNX11-203ENST00000452859 1601 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 TNFRSF18-203ENST00000379268 1179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 CPEB2-203ENST00000382395 5524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 IZUMO4-203ENST00000395307 944 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 LINC01786-202ENST00000453732 389 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
SCGB3A2Q96PL1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.9 ms