Protein–RNA interactions for Protein: Q96NB1

FOPNL, LisH domain-containing protein FOPNL, humanhuman

Predictions only

Length 174 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOPNLQ96NB1 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 TRPC1-203ENST00000476941 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 HBEGF-201ENST00000230990 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 CYR61-201ENST00000451137 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 SIKE1-201ENST00000060969 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 PNKP-224ENST00000631020 1545 ntTSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 TAL1-201ENST00000294339 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 TMEM179-201ENST00000341595 2513 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 ARID1B-202ENST00000346085 10194 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 CDX1-202ENST00000616154 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
FOPNLQ96NB1 AHRR-204ENST00000506456 2350 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 KCNH1-210ENST00000640044 1818 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 POMZP3-201ENST00000275569 1259 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 TERF1P1-201ENST00000311003 1181 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 H2AFB2-201ENST00000354514 348 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 SNCB-205ENST00000510387 730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 AC010203.1-204ENST00000548782 407 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 MIR3180-4-201ENST00000582223 153 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 TACC1-202ENST00000317827 7802 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 TMEM109-201ENST00000227525 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 SARAF-214ENST00000545648 1976 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 NUP153-202ENST00000537253 6030 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 FOLH1-203ENST00000343844 2258 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 AC005082.1-201ENST00000413042 2259 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 COQ10B-201ENST00000263960 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 GPC5-201ENST00000377067 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 LY6L-201ENST00000562505 988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 ENTPD6-201ENST00000354989 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 NOTCH2NL-204ENST00000579793 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 RAB1A-204ENST00000409892 2254 ntTSL 2 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
FOPNLQ96NB1 PLCL2-204ENST00000615277 4147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.6 ms