Protein–RNA interactions for Protein: Q96M96

FGD4, FYVE, RhoGEF and PH domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 766 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FGD4Q96M96 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 ADGRL1-202ENST00000361434 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 TYMS-202ENST00000323250 693 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 CKLF-202ENST00000345436 571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 LGI2-201ENST00000382114 6428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 ZDHHC5-201ENST00000287169 4666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 NEURL4-203ENST00000570460 4890 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 ARMC12-202ENST00000373866 1254 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 UBXN10-AS1-201ENST00000442226 510 ntTSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 PQLC2L-205ENST00000461040 563 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 LINC01711-201ENST00000598340 967 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 RNF38-204ENST00000357058 5254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 MAPK9-208ENST00000455781 4336 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC20.81■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 KMT5B-205ENST00000402789 1599 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 FUBP3-201ENST00000319725 3124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 PROB1-201ENST00000434752 5122 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 AC087289.1-201ENST00000586808 890 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 ADM-207ENST00000530439 1839 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 ZIM2-208ENST00000629319 2253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 UNG-202ENST00000336865 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC20.8■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 PDZD3-203ENST00000525131 1882 ntTSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 FA2H-201ENST00000219368 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 ANKRD53-202ENST00000360589 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.79■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 ARMC6-220ENST00000546344 1814 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 TIMM8A-201ENST00000372902 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 AL133343.2-201ENST00000457213 370 ntTSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 ESR2-212ENST00000556275 2695 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 MRGPRF-201ENST00000309099 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.78■□□□□ 0.92
FGD4Q96M96 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.8 ms