Protein–RNA interactions for Protein: Q96M43

NBPF4, Neuroblastoma breakpoint family member 4, humanhuman

Predictions only

Length 638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NBPF4Q96M43 EYA2-202ENST00000327619 2702 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 FARSA-202ENST00000423140 1720 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 HTR1E-201ENST00000305344 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 GFI1-202ENST00000370332 2855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 ZFAND2B-207ENST00000409412 569 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 PPP4R2-201ENST00000356692 4984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 CDC42EP1-201ENST00000249014 2181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 STARD3-219ENST00000580611 1989 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 TMED4-201ENST00000289577 2203 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 LINC01197-204ENST00000611265 956 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 IRF7-203ENST00000397566 2051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 TSPAN17-202ENST00000310032 2550 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 STAP2-201ENST00000594605 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 HNRNPLL-203ENST00000378915 2523 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 CNTNAP3B-202ENST00000341990 2666 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 SH3RF3-201ENST00000309415 5803 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 GAS2L1-208ENST00000616432 2925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 ST3GAL4-209ENST00000526727 1967 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 MBD1-216ENST00000587605 1945 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 PAN3-201ENST00000380958 2833 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 FTMT-201ENST00000321339 879 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 FGFR3P6-201ENST00000457012 610 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
NBPF4Q96M43 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.3 ms