Protein–RNA interactions for Protein: Q96L94

SNX22, Sorting nexin-22, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX22Q96L94 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 HCRT-201ENST00000293330 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 TSPAN14-205ENST00000372158 1095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 ERICH4-201ENST00000378187 946 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 PLEKHB2-203ENST00000404460 1167 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 CACYBP-202ENST00000405362 1059 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 IGFALS-202ENST00000415638 2136 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 AC007663.1-201ENST00000438948 1240 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 PHB2-202ENST00000440277 996 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 TSPY15P-201ENST00000457163 923 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 LINC01184-202ENST00000501173 949 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 NDUFB10-202ENST00000543683 830 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 RAB11B-AS1-201ENST00000593581 1013 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 ANKS3-201ENST00000304283 2662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 POLR3E-209ENST00000564209 2464 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 ETV7-202ENST00000340181 1719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 TFCP2-205ENST00000549867 1727 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 ULK3-201ENST00000440863 2623 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 MLF2-202ENST00000435120 1379 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 PTTG1IP-204ENST00000445724 2497 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 ISL2-201ENST00000290759 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 CLN3-206ENST00000360019 1840 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 GXYLT1P6-201ENST00000456472 1187 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 RPL29-202ENST00000466397 742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 AC079385.1-202ENST00000549203 569 ntTSL 4 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 MIR4674-201ENST00000582457 87 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 GAS2L1P2-202ENST00000442849 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 ADGRG2-202ENST00000354791 4494 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 KCNQ2-213ENST00000626839 9213 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 RABL2B-205ENST00000395595 2428 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 PRR5-201ENST00000006251 1767 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 MCU-202ENST00000373053 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 PEX16-202ENST00000378750 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 TAB2-209ENST00000637181 4230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 TMIGD2-201ENST00000301272 1262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 ING1-202ENST00000338450 1189 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 AL390719.1-201ENST00000427998 977 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 FAU-207ENST00000529639 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 RAB2A-211ENST00000531289 1058 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
SNX22Q96L94 CTNNBL1-201ENST00000361383 1925 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 AC126763.1-201ENST00000552015 2118 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 MAP4K4-205ENST00000350878 7640 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 MUTYH-202ENST00000355498 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 CLN8-211ENST00000636934 1790 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 HOXA9-201ENST00000343483 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
SNX22Q96L94 SHISA5-220ENST00000619810 2385 ntTSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.3 ms