Protein–RNA interactions for Protein: Q96KN3

PKNOX2, Homeobox protein PKNOX2, humanhuman

Predictions only

Length 472 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKNOX2Q96KN3 TSPAN4-206ENST00000397408 1430 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 AC008687.4-201ENST00000637680 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 TMEM229B-201ENST00000357461 4068 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 CYP7B1-201ENST00000310193 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 CORO1B-201ENST00000341356 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 SLC1A4-201ENST00000234256 4561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 TMEM191A-208ENST00000450925 1961 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 TP53I3-202ENST00000335934 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 KCNQ2-215ENST00000629241 2853 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 SLC1A7-204ENST00000611397 2499 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 FAM163A-201ENST00000341785 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 GGT6-202ENST00000381550 2145 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 AC105265.2-201ENST00000467189 838 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 CDV3P1-201ENST00000471403 739 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 LINC00926-202ENST00000502027 2141 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 KRT18P20-201ENST00000548986 1279 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 AL356652.1-201ENST00000615962 565 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 C15orf56-202ENST00000623360 2129 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 TOR1AIP1-201ENST00000271583 3044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 TRIB2-202ENST00000381465 2778 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 FUBP1-203ENST00000370768 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 AC087633.2-202ENST00000565166 1439 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 FIBIN-201ENST00000318627 1938 ntAPPRIS P1 BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 KIAA1211-203ENST00000504228 4628 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 CBFB-201ENST00000290858 3136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 PLPPR5-202ENST00000370188 4139 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 HES4-201ENST00000304952 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 EDA-201ENST00000338901 1233 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 AL031963.3-201ENST00000606441 850 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 CYP2E1-205ENST00000463117 1912 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 PHF20L1-201ENST00000220847 3297 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 SCARF1-201ENST00000263071 3443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 MCRIP1-207ENST00000574190 2775 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 CHRD-201ENST00000204604 3521 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 TNKS1BP1-201ENST00000358252 5795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 SPEG-203ENST00000396688 1457 ntTSL 3 BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 ACVR1B-201ENST00000257963 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 PTBP1P-201ENST00000554374 1601 ntBASIC19.91■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 RNH1-202ENST00000356187 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 MLST8-232ENST00000569417 1870 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 LMNB1-201ENST00000261366 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 LRRC3-201ENST00000291592 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 PRMT2-206ENST00000397638 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 ZNF74-209ENST00000611540 3714 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 LINC01816-201ENST00000414141 662 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 Z99774.1-201ENST00000382641 2613 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 KRT8P20-201ENST00000423953 1409 ntBASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 SYT8-201ENST00000341958 1556 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 ZNF843-203ENST00000618063 1765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 PHKA2-201ENST00000379942 5559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 MUS81-215ENST00000533035 2180 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC19.9■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 TBC1D25-201ENST00000376771 4042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.78
PKNOX2Q96KN3 PABPC1L-202ENST00000217074 1263 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 NECAB3-201ENST00000246190 1989 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 HAUS4-203ENST00000347758 1428 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
PKNOX2Q96KN3 SETD7-202ENST00000404104 1590 ntTSL 2 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms