Protein–RNA interactions for Protein: Q96JW4

SLC41A2, Solute carrier family 41 member 2, humanhuman

Predictions only

Length 573 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC41A2Q96JW4 MEN1-209ENST00000394376 3034 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 MARK2-203ENST00000377810 4560 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 ARRDC2-201ENST00000222250 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 AP000547.2-201ENST00000609641 661 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 IGHV3-41-201ENST00000613121 348 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 AC243773.1-201ENST00000614759 544 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 RBFA-202ENST00000306735 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
SLC41A2Q96JW4 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 AL353692.3-201ENST00000407031 1396 ntBASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 LINC01356-201ENST00000401018 1819 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 COL13A1-205ENST00000398978 3093 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 PHF12-202ENST00000332830 4759 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 CD55-201ENST00000314754 2220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 FAM129C-201ENST00000332386 2222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 SPAST-203ENST00000615843 5212 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 MAPK8IP1-201ENST00000241014 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 LDHAL6A-202ENST00000396213 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 CST3-202ENST00000398409 832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 TOB2P1-201ENST00000469761 992 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 AL121894.2-201ENST00000602977 491 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 OGFOD2-201ENST00000228922 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 TAPT1-201ENST00000405303 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 RIMBP3C-201ENST00000331505 5475 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 ANKRD40-201ENST00000285243 4184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 FAM239B-201ENST00000381106 1099 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 GUSBP12-201ENST00000513727 720 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 AC012615.1-201ENST00000565797 1299 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 AL592071.1-201ENST00000611956 408 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 FAM213B-204ENST00000419916 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
SLC41A2Q96JW4 NR5A1-202ENST00000373588 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms