Protein–RNA interactions for Protein: Q96JA1

LRIG1, Leucine-rich repeats and immunoglobulin-like domains protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,093 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LRIG1Q96JA1 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 AC010655.4-201ENST00000462662 707 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 AC090616.6-201ENST00000582640 721 ntBASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 DEF8-211ENST00000563795 1767 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 EPHA10-202ENST00000373048 5425 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 SNX27-204ENST00000458013 6403 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 SMIM24-201ENST00000215531 1329 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 VPS37D-202ENST00000451519 1303 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 TBX20-201ENST00000408931 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 LPCAT3-201ENST00000261407 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 COL15A1-201ENST00000375001 5496 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 ZNF768-202ENST00000562803 1999 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 CCNG1-208ENST00000510664 994 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 TMSB15B-201ENST00000419165 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 AC018445.3-201ENST00000624177 1945 ntBASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 EGFL7-203ENST00000371699 2125 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 ARHGAP22-203ENST00000374172 2380 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 GLRB-207ENST00000541722 2765 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 ENTPD8-202ENST00000371506 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 THAP7-AS1-203ENST00000452284 2298 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 PSTPIP1-203ENST00000558012 1896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 GCDH-216ENST00000591470 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 RHOT2-201ENST00000315082 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 KCNK7-202ENST00000342202 1283 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 RPUSD3-201ENST00000383820 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 CCDC88B-202ENST00000356786 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 POMC-204ENST00000405623 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 DDT-203ENST00000403754 569 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 RPS14-203ENST00000407193 784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 DDT-206ENST00000430101 573 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 HOXB8-203ENST00000576562 743 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 AC008878.4-201ENST00000602083 293 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 CCDC74A-206ENST00000467992 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 WNK1-203ENST00000447667 1902 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 LINC02381-201ENST00000508564 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 C16orf70-201ENST00000219139 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 CRTAC1-203ENST00000370597 2890 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 RNF212-202ENST00000382968 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 SEPT8-216ENST00000620483 4335 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
LRIG1Q96JA1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms