Protein–RNA interactions for Protein: Q96FN4

CPNE2, Copine-2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPNE2Q96FN4 AC011298.2-201ENST00000617989 482 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
CPNE2Q96FN4 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 WWOX-214ENST00000566780 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 SETMAR-206ENST00000430981 1671 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 CTNNBL1-204ENST00000405275 2076 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 SCFD2-204ENST00000611795 1320 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 FOXD4L6-201ENST00000622588 2034 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 AL139130.1-201ENST00000451362 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 ECE1-203ENST00000374893 2484 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 TNFRSF1A-213ENST00000540022 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 TMEM35B-201ENST00000373337 922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 METTL5-206ENST00000409965 880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 LRRN4CL-201ENST00000317449 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 PDLIM3-201ENST00000284767 2589 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 C20orf27-201ENST00000217195 1302 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 PSMD8-210ENST00000620216 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 ZNF420-201ENST00000304239 1945 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 ZNF846-205ENST00000588267 1943 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 WASF1-202ENST00000359451 3075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 AC022916.1-201ENST00000590478 2658 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 AP005717.1-201ENST00000500705 1899 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 AC096719.1-201ENST00000510705 1874 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 CMTM8-201ENST00000307526 1174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 SERF1A-201ENST00000317633 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 AC091390.4-202ENST00000476426 537 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 ISG20-210ENST00000560741 800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 ADD3-AS1-204ENST00000627565 388 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 IFNL4-203ENST00000634680 1421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 RNFT2-202ENST00000319176 2180 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 RNFT2-209ENST00000622220 2176 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 PKMYT1-203ENST00000431515 2308 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 PDLIM7-203ENST00000359895 1567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 GPR137-204ENST00000438980 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 NUDT16-201ENST00000502852 1552 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 NARFL-201ENST00000251588 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 RCC2P3-201ENST00000418112 1537 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 ACBD4-215ENST00000592162 1684 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 QPCTL-202ENST00000366382 1814 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 AL357033.4-201ENST00000617703 1807 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 HNF1A-202ENST00000400024 2337 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 GJA4-201ENST00000342280 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 APBB1-210ENST00000530885 1626 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 HAUS4-218ENST00000555986 1626 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 PPP1R9B-202ENST00000612501 4167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 BID-202ENST00000342111 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
CPNE2Q96FN4 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms