Protein–RNA interactions for Protein: Q96EY1

DNAJA3, DnaJ homolog subfamily A member 3, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA3Q96EY1 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 ZNF692-204ENST00000451251 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 SNHG10-201ENST00000500370 1531 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 IGSF9B-206ENST00000533871 5050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 FBXW9-203ENST00000587955 1437 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 KANK3-201ENST00000330915 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 PPP4C-202ENST00000561610 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 KRT17P2-202ENST00000326333 1174 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 HOXD12-201ENST00000404162 841 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 AC009487.1-202ENST00000437683 402 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 HRASLS5-205ENST00000539221 1167 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 CCDC28A-203ENST00000617445 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 AC008735.6-201ENST00000635964 1292 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 UBE2O-201ENST00000319380 5436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 GRAMD2B-218ENST00000542322 2977 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 BICRA-201ENST00000396720 5739 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 DMRTA1-201ENST00000325870 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 FBXL17-201ENST00000359660 4510 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 ILK-203ENST00000420936 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 OR13J1-201ENST00000377981 1339 ntAPPRIS P1 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 ZNF385B-204ENST00000410066 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 TTC34-201ENST00000401095 8814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 S100A16-203ENST00000368705 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 CLDND2-203ENST00000601435 575 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 SOGA3-203ENST00000525778 4077 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 TRIM63-201ENST00000374272 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 PRDM1-202ENST00000369091 2612 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 SENP2-201ENST00000296257 5717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 NAPRT-202ENST00000426292 1654 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 ST3GAL3-201ENST00000262915 2470 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 CBS-203ENST00000398158 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 LARGE2-206ENST00000529052 2459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 HMBS-221ENST00000544387 1351 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 CBSL-206ENST00000624406 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 PHOSPHO2-201ENST00000359744 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 Telomerase-vert.1-201ENST00000363312 438 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 STXBP1-203ENST00000476182 566 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 DIO1-206ENST00000525202 558 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 AC090970.2-201ENST00000561318 865 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 AL929554.1-201ENST00000568665 460 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 CACNA1B-204ENST00000371357 9642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 POM121C-208ENST00000615331 5835 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 RNF169-201ENST00000299563 7823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 CDC42EP3-201ENST00000295324 5700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 ZBTB33-201ENST00000326624 5211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
DNAJA3Q96EY1 PGP-201ENST00000333503 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.1 ms