Protein–RNA interactions for Protein: Q96DT6

ATG4C, Cysteine protease ATG4C, humanhuman

Predictions only

Length 458 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATG4CQ96DT6 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 IKBKG-214ENST00000618670 2069 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 PCDH8-202ENST00000377942 5088 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 RAX-202ENST00000334889 3197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 TP73-AS1-207ENST00000624167 988 ntBASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 C6orf141-206ENST00000529246 1450 ntAPPRIS P1 BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 CPEB2-202ENST00000345451 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 ADK-206ENST00000541550 2222 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 RWDD3-202ENST00000370202 1235 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 DMRT2-205ENST00000382255 2367 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 TINCR-201ENST00000448587 3733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 CDCA4-201ENST00000336219 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 C18orf25-204ENST00000615553 2329 ntTSL 5 BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 MAST2-201ENST00000361297 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 SMIM10L2A-201ENST00000417443 5230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 SPNS1-201ENST00000311008 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 AC008610.1-201ENST00000504573 393 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 TCAIM-203ENST00000396078 2178 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 EPN3-216ENST00000537145 2223 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 GRK2-201ENST00000308595 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 LINC00882-201ENST00000473636 710 ntTSL 3 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
ATG4CQ96DT6 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC21.02■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 FDXR-202ENST00000413947 1809 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 MGAT5B-201ENST00000301618 4486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 MARK2-204ENST00000402010 4728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 SHOX2-203ENST00000441443 3038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
ATG4CQ96DT6 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms