Protein–RNA interactions for Protein: Q96BQ1

FAM3D, Protein FAM3D, humanhuman

Predictions only

Length 224 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM3DQ96BQ1 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 EEF1AKMT2-201ENST00000368836 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 MAFG-202ENST00000392366 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 AP003071.5-201ENST00000641568 2695 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 XBP1-202ENST00000344347 1131 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 PIGP-203ENST00000399098 972 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 ASMTL-AS1-203ENST00000425740 840 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 GCC2-AS1-202ENST00000440975 574 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 STPG4-207ENST00000445927 891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 ASH1L-AS1-202ENST00000456633 911 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 ZFPL1-203ENST00000525509 478 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 PNKP-207ENST00000596014 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 CHTOP-207ENST00000614256 1840 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 HMGXB3-201ENST00000502717 4974 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 CBFB-202ENST00000412916 2971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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FAM3DQ96BQ1 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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FAM3DQ96BQ1 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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FAM3DQ96BQ1 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 LRRC75A-AS1-205ENST00000475953 1201 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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FAM3DQ96BQ1 TRAPPC3-208ENST00000616074 1114 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 KAZN-209ENST00000636564 1197 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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FAM3DQ96BQ1 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 KCNK3-201ENST00000302909 6162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
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FAM3DQ96BQ1 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
FAM3DQ96BQ1 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 OBSL1-201ENST00000289656 2274 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 KCNQ5-212ENST00000628967 3527 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 ENC1-205ENST00000510316 5381 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 FAM86C1-203ENST00000426628 952 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 LINC01881-205ENST00000456398 1235 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 AC226101.2-201ENST00000458252 747 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 C17orf107-202ENST00000521575 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
FAM3DQ96BQ1 CMTM3-207ENST00000564060 824 ntTSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
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