Protein–RNA interactions for Protein: Q96BF3

TMIGD2, Transmembrane and immunoglobulin domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD2Q96BF3 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 AL390860.1-201ENST00000449298 1541 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 AL357673.1-201ENST00000637610 2542 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 TP53BP2-201ENST00000343537 4651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 PCGF6-202ENST00000369847 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 WIPI2-201ENST00000288828 4476 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 COL16A1-203ENST00000373672 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 GATA3-201ENST00000346208 2654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 WWOX-202ENST00000402655 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 GUSBP6-202ENST00000438529 1198 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 CDH18-AS1-201ENST00000513573 424 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 SLC3A2-201ENST00000338663 1904 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 PQLC2-203ENST00000400548 1548 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 KTI12-201ENST00000371614 1714 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 CHAT-201ENST00000337653 2458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 TFP1-202ENST00000475455 1573 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 DBNDD2-203ENST00000372710 1417 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 AC091729.3-201ENST00000423008 1401 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 AC008741.2-201ENST00000612792 3115 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 BX276092.2-201ENST00000417668 665 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 FAM229A-204ENST00000432622 699 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 FBXL8-203ENST00000518148 1054 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 LINC01956-201ENST00000557729 695 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 ANAPC11-208ENST00000572851 686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 DSCAM-201ENST00000400454 8552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 ACBD4-202ENST00000376955 1453 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 GOLGA4-208ENST00000444882 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 PIAS4-201ENST00000262971 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 GAR1-201ENST00000226796 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 FAM72A-203ENST00000367129 676 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 CLDN3-201ENST00000395145 1274 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 SERPINH1P1-201ENST00000419794 1249 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 FAM72A-205ENST00000468509 629 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 SNHG6-203ENST00000520944 638 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 AC018730.2-201ENST00000598623 443 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 BRWD1-AS2-201ENST00000603064 1028 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 AL772284.2-201ENST00000620151 1147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 AC000035.1-201ENST00000634116 343 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 SPON2-203ENST00000431380 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
TMIGD2Q96BF3 TNFSF9-201ENST00000245817 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms