Protein–RNA interactions for Protein: Q969T3

SNX21, Sorting nexin-21, humanhuman

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX21Q969T3 AC007192.1-201ENST00000593731 5142 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 TMEM223-201ENST00000307366 1288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 CLN6-207ENST00000566347 981 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 CDC25B-202ENST00000340833 1978 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 SYT7-209ENST00000542836 1362 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 NAT9-201ENST00000357814 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ZNF865-201ENST00000568956 4005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 DCP1B-201ENST00000280665 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 CLDND2-201ENST00000291715 974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 JDP2-202ENST00000419727 972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 FAM207BP-201ENST00000447172 505 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ASPHD1-203ENST00000483405 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 MIR381HG-201ENST00000553692 425 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
SNX21Q969T3 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 HOOK2-202ENST00000397668 2513 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 WDR13-201ENST00000218056 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 TAF15-211ENST00000604841 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 AC116565.2-201ENST00000637674 1854 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 TTC9B-201ENST00000311308 843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 NREP-209ENST00000455559 698 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 AP002982.1-201ENST00000492365 877 ntBASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 RPS23-206ENST00000510210 1058 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 TSTD3-202ENST00000636394 336 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 KRT16P1-201ENST00000399124 1418 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 FAM83H-201ENST00000388913 5654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 BPHL-203ENST00000380379 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 YWHAZ-209ENST00000419477 891 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 TMEM235-204ENST00000551068 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 ASRGL1-211ENST00000628829 1161 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 NOMO3-202ENST00000399336 4356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 PARP16-202ENST00000444347 2352 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 TRAK2-202ENST00000430254 1436 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 PLEKHG5-207ENST00000400913 4698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 TRAM1-201ENST00000262213 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
SNX21Q969T3 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms