Protein–RNA interactions for Protein: Q92879

CELF1, CUGBP Elav-like family member 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 486 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CELF1Q92879 RAD52-211ENST00000536177 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 HOXB9-201ENST00000311177 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 ASL-204ENST00000395331 1538 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 TMEM213-202ENST00000413208 480 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 SMAD3-210ENST00000559092 584 ntTSL 4 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
CELF1Q92879 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 LGI3-202ENST00000424267 3114 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 REXO2-206ENST00000539275 710 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 CD151-203ENST00000397421 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 CXXC4-201ENST00000394767 5565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 DMWD-202ENST00000377735 3292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 NFIB-207ENST00000397579 3129 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 VEGFA-206ENST00000372077 2834 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 FAM217A-201ENST00000274673 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 AL773604.1-201ENST00000617417 272 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 AQP11-201ENST00000313578 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 NSUN2-206ENST00000506139 2619 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 AC116562.4-201ENST00000641316 2276 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 EVL-202ENST00000402714 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 ST3GAL4-205ENST00000449406 1669 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 LGALS7B-201ENST00000314980 483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 KRT18P67-201ENST00000432816 1264 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 AC008608.2-201ENST00000606089 416 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 PCDHA4-201ENST00000378125 2328 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
CELF1Q92879 ESYT3-201ENST00000289135 1356 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms