Protein–RNA interactions for Protein: Q8WZ74

CTTNBP2, Cortactin-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,663 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTTNBP2Q8WZ74 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTTNBP2Q8WZ74 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTTNBP2Q8WZ74 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
CTTNBP2Q8WZ74 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.28
CTTNBP2Q8WZ74 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 STMN3-201ENST00000370053 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC29.26■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 ARSA-203ENST00000395619 1824 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 ANXA8-208ENST00000611843 2174 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC29.26■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 MALT1-201ENST00000345724 2866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 LRRC28-210ENST00000558879 581 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 ANKRD34C-AS1-205ENST00000560452 576 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 PNMT-203ENST00000581428 677 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 CLEC11A-203ENST00000617718 1128 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 NSUN5P2-201ENST00000388955 1789 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 HOXC13-201ENST00000243056 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 USP39-202ENST00000409025 1946 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 TSNAXIP1-202ENST00000415766 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 SLC25A3P1-206ENST00000569142 925 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC012615.5-201ENST00000592720 581 ntTSL 4 BASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 FAM215A-202ENST00000632077 792 ntBASIC29.25■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 ATOH8-201ENST00000306279 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 PTGIR-201ENST00000291294 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 OGFOD2-207ENST00000536150 1956 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 ASAH1-255ENST00000637638 699 ntTSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 GSDMD-201ENST00000262580 1762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 MON1A-202ENST00000417270 2527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 FFAR3-201ENST00000327809 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC093909.1-201ENST00000504731 1122 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC29.23■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 DLX2-201ENST00000234198 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.23■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 CFC1B-203ENST00000620207 1444 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 GNAI1-201ENST00000351004 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 COL23A1-201ENST00000390654 3061 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 ERLIN2-202ENST00000335171 1742 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 MRPL28-201ENST00000199706 1098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC010327.4-202ENST00000591484 748 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC29.22■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 C11orf80-214ENST00000532565 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 SMARCD2-212ENST00000613943 2342 ntTSL 5 BASIC29.22■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 SPINT1-AS1-203ENST00000565315 629 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 HDAC2-201ENST00000368632 2084 ntTSL 2 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 RAB17-203ENST00000409576 466 ntTSL 3 BASIC29.21■■■□□ 2.27
CTTNBP2Q8WZ74 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.3 ms