Protein–RNA interactions for Protein: Q8WV48

CCDC107, Coiled-coil domain-containing protein 107, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC107Q8WV48 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 KRASP1-201ENST00000407852 552 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 AC137630.1-201ENST00000452042 782 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 B3GAT3-205ENST00000534026 1120 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 AL160286.2-201ENST00000567150 934 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 TPGS2-221ENST00000614939 1268 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 CORO1B-210ENST00000627576 960 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 C9orf66-201ENST00000382387 2918 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 OGG1-201ENST00000302003 1655 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 NRG2-205ENST00000361474 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 SMPD1-203ENST00000527275 2188 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 DDX31-206ENST00000480876 1333 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 ZDHHC20-209ENST00000542645 5315 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 STRA6-209ENST00000563965 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 RRS1-201ENST00000320270 1706 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 ARNTL2-208ENST00000544915 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 SYNE3-202ENST00000553340 2615 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 MMAB-206ENST00000540016 945 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 C17orf97-203ENST00000571106 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 TBCB-214ENST00000629269 413 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 C20orf204-205ENST00000636176 961 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 HLA-A-209ENST00000638375 975 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 SLC27A2-202ENST00000380902 2181 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 MEN1-203ENST00000337652 3162 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 TSPAN17-201ENST00000298564 2810 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 RSBN1-205ENST00000615321 2418 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 CEACAM3-202ENST00000357396 1316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 DDAH2-211ENST00000375787 1330 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 TBC1D2B-201ENST00000300584 6067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 SAMD11-210ENST00000616016 2391 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 NDRG2-227ENST00000554143 1980 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 SUZ12-204ENST00000580398 3977 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 MATN4-201ENST00000353917 1657 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 RELL2-201ENST00000297164 2520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 LINC02361-201ENST00000538731 1484 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 CEMP1-202ENST00000567119 1374 ntAPPRIS P2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 ZDHHC12-202ENST00000372667 1187 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 GPSM1-203ENST00000392944 1111 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 AC239809.2-201ENST00000415381 517 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 CHAC1-202ENST00000446533 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 PODNL1-203ENST00000538371 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 IFRD1-201ENST00000005558 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 RNASEH2C-203ENST00000528220 1337 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 IL6R-208ENST00000622330 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
CCDC107Q8WV48 THOC6-209ENST00000575576 1360 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.6 ms