Protein–RNA interactions for Protein: Q8TE77

SSH3, Protein phosphatase Slingshot homolog 3, humanhuman

Predictions only

Length 659 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSH3Q8TE77 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.23
SSH3Q8TE77 MAFF-206ENST00000538320 2458 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 C17orf49-208ENST00000552402 760 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 AC099518.3-201ENST00000564808 809 ntAPPRIS P5 TSL 4 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 FAM131A-202ENST00000340957 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 SNX18-203ENST00000381410 5218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 ANKS3-230ENST00000614075 2387 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 LRRC43-201ENST00000339777 2028 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 NTMT1-203ENST00000372483 1315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 AC004540.1-201ENST00000439120 891 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 EDC4-201ENST00000358933 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 KLHL17-201ENST00000338591 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 MINPP1-201ENST00000371994 2183 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 TMEM218-206ENST00000527766 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 C6orf48-210ENST00000614363 748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 ATP6V0E2-203ENST00000456496 2722 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 ATP6V0E2-213ENST00000615196 2727 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 LINC00535-201ENST00000501400 1914 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 SEMA3B-210ENST00000611067 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 PIF1-205ENST00000559239 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 RNF146-201ENST00000309649 2624 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 NOL3-201ENST00000268605 1394 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 POR-209ENST00000439269 1858 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 ERICH1-201ENST00000262109 1813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 AGTRAP-201ENST00000314340 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 TNNI3-201ENST00000344887 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 AC113404.2-201ENST00000507884 177 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 C12orf76-204ENST00000547573 607 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 PAQR4-204ENST00000574988 869 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 LUC7L2-210ENST00000619796 2783 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 CDC14B-203ENST00000375242 2965 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 PRKAR1B-212ENST00000544935 2494 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 RAX2-201ENST00000555633 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 TXNRD3-202ENST00000523403 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 WRNIP1-202ENST00000380769 3239 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 RNF38-202ENST00000350199 5104 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
SSH3Q8TE77 MMAB-204ENST00000537236 1342 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms