Protein–RNA interactions for Protein: Q8NFU0

BEST4, Bestrophin-4, humanhuman

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Length 473 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BEST4Q8NFU0 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 FBXL12-205ENST00000586651 1736 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 PLAC9-202ENST00000372267 472 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 IL15RA-207ENST00000397250 584 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 DUSP5P2-201ENST00000426873 1033 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 DNAJA4-210ENST00000489435 947 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 IL15RA-215ENST00000528354 1037 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 JOSD2-202ENST00000595669 733 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 IL15RA-220ENST00000620345 1115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 ZNF454-201ENST00000320129 2332 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 SNCA-203ENST00000394986 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 HAUS4-204ENST00000490506 1447 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 JKAMP-202ENST00000356057 2524 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 CMTM3-214ENST00000567572 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 ARAP1-AS2-201ENST00000500163 1824 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 RNPS1-203ENST00000397086 2069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 METTL21A-203ENST00000411432 4805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 TMEFF2-201ENST00000272771 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 RRAGD-202ENST00000369415 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 ARL2-201ENST00000246747 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 GNAS-AS1-201ENST00000424094 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 ZNF324-202ENST00000535298 1006 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AC007786.1-201ENST00000587859 709 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AC012313.6-201ENST00000599889 790 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 SLC12A5-217ENST00000626937 1224 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 ZBTB9-201ENST00000395064 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 PP12613-201ENST00000424958 2230 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 TSPYL5-201ENST00000322128 4491 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 WIZ-201ENST00000263381 5695 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 TBC1D2-202ENST00000375063 2100 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 RHBDL1-202ENST00000352681 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 GBA2-203ENST00000378103 3611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 CAPN15-201ENST00000219611 4744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 MFSD10-202ENST00000355443 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 SEC11C-202ENST00000509791 2054 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 SNAI3-AS1-205ENST00000568633 2096 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 P4HB-203ENST00000439918 1502 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 EXOSC3-201ENST00000327304 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AP2S1-201ENST00000263270 935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 PPP1R14A-202ENST00000347262 637 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 CABP2-202ENST00000353903 789 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AC114730.2-201ENST00000417267 668 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 ABHD17AP6-201ENST00000458502 1044 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 LIME1-205ENST00000480139 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AC006252.1-201ENST00000483834 1101 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 AL050303.2-201ENST00000619798 666 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 OGFR-204ENST00000621591 1194 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 SENP5-201ENST00000323460 6308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 LRRC29-209ENST00000629962 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 POLR3H-202ENST00000355209 4416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 GAS2L1P1-201ENST00000420145 1480 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 KXD1-202ENST00000539106 1496 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
BEST4Q8NFU0 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
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