Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEP4

C17orf47, Uncharacterized protein C17orf47, humanhuman

Predictions only

Length 570 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C17orf47Q8NEP4 MAP3K7CL-206ENST00000399928 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C17orf47Q8NEP4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C17orf47Q8NEP4 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
C17orf47Q8NEP4 SLC6A9-201ENST00000357730 2168 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C17orf47Q8NEP4 AL390961.4-201ENST00000623958 2535 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
C17orf47Q8NEP4 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C17orf47Q8NEP4 NFATC1-201ENST00000253506 4642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
C17orf47Q8NEP4 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C17orf47Q8NEP4 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C17orf47Q8NEP4 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C17orf47Q8NEP4 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C17orf47Q8NEP4 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C17orf47Q8NEP4 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C17orf47Q8NEP4 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C17orf47Q8NEP4 NUMBL-202ENST00000540131 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C17orf47Q8NEP4 ARRB1-201ENST00000360025 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
C17orf47Q8NEP4 AC073592.3-201ENST00000625118 1834 ntBASIC17.08■□□□□ 0.33
C17orf47Q8NEP4 KCNIP4-205ENST00000382152 1767 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
C17orf47Q8NEP4 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 SEPT8-201ENST00000296873 4394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 SRRM2-AS1-203ENST00000571305 1344 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 COMTD1-201ENST00000372538 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 PLCB1-204ENST00000404098 1260 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 AC020911.2-202ENST00000588945 593 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 YIPF2-209ENST00000590329 958 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 PAQR4-202ENST00000318782 2793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 IFFO1-204ENST00000396840 2677 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 PRODH-215ENST00000610940 2405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 SEMA6D-205ENST00000389425 2318 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 ZBTB8A-201ENST00000316459 1943 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 ARHGEF18-202ENST00000359920 5733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 ULK1-201ENST00000321867 5310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 NPEPL1-203ENST00000525817 1780 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 CNOT6-201ENST00000261951 6176 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 MAN1B1-207ENST00000535144 2296 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 ZNF446-203ENST00000594369 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 LCE3D-201ENST00000368787 613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 AC004540.1-203ENST00000421862 907 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 MALL-203ENST00000427178 1070 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 NME3-204ENST00000563498 920 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 AL049597.2-201ENST00000565575 961 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 RIMKLB-202ENST00000357529 5830 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 GUCY1A2-201ENST00000282249 3047 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 WRB-201ENST00000333781 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 IFRD2-204ENST00000436390 2275 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 MICU3-201ENST00000318063 3992 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 SNAI3-AS1-202ENST00000563475 2081 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 SPAG4-201ENST00000374273 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 ANKRD10-201ENST00000267339 2495 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 AC018755.2-202ENST00000429354 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 CTSA-201ENST00000191018 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 C10orf142-201ENST00000619243 1110 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 WNK2-204ENST00000427277 6108 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 CCDC17-209ENST00000528266 2181 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 TXNRD3-203ENST00000524230 2950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 HLA-G-205ENST00000428701 1578 ntAPPRIS P2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 C3orf70-201ENST00000335012 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 CALHM2-201ENST00000260743 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
C17orf47Q8NEP4 WNT5B-203ENST00000537031 1437 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms