Protein–RNA interactions for Protein: Q8NEB9

PIK3C3, Phosphatidylinositol 3-kinase catalytic subunit type 3, humanhuman

Predictions only

Length 887 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3C3Q8NEB9 ARHGEF28-212ENST00000513042 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 DVL2-209ENST00000575458 2659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 CERS4-201ENST00000251363 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 DHRS4-204ENST00000543741 1340 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 MOAP1-201ENST00000298894 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 PLAUR-203ENST00000340093 1548 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 SERF2-207ENST00000409614 582 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 METTL21A-204ENST00000425132 869 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 CCDC124-201ENST00000445755 938 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 SIVA1-203ENST00000535554 1244 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 AC009090.2-201ENST00000565829 472 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 LRRC75A-AS1-225ENST00000581913 1091 ntTSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 ZNF667-AS1-206ENST00000591797 535 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 CCDC124-203ENST00000597436 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 AL158152.2-201ENST00000602703 235 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 AC110285.5-201ENST00000611501 352 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 AIFM3-203ENST00000405089 2333 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 PHRF1-205ENST00000533464 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 LURAP1-201ENST00000371980 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 HOXC13-AS-201ENST00000512916 1408 ntTSL 3 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 PCDH7-206ENST00000543491 4457 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 ZCWPW1-202ENST00000398027 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 PNMA6E-201ENST00000445091 2192 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 EDA-208ENST00000524573 1381 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 LRCH2-202ENST00000538422 4868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 STAMBPL1-203ENST00000371926 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 PRSS36-201ENST00000268281 2840 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 TSTD1-201ENST00000318289 626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 SPATA2L-202ENST00000335360 1001 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 PHYHD1-207ENST00000421063 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 KRT16P5-201ENST00000455284 522 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 NDUFS6-202ENST00000469176 550 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 FBXO17-202ENST00000595329 1299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 L34079.3-201ENST00000600242 546 ntTSL 4 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 CROCCP4-202ENST00000633627 573 ntTSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 NRXN1-209ENST00000405581 5078 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
PIK3C3Q8NEB9 ZBTB11-202ENST00000461821 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 WSCD1-209ENST00000574232 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 CHMP4A-201ENST00000347519 1393 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 LINC00636-201ENST00000494231 1264 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 RNF121-214ENST00000533380 870 ntTSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 TARDBP-228ENST00000629725 1031 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 MSI2-203ENST00000416426 1714 ntTSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 CDH22-203ENST00000537909 3902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 KRT8P32-201ENST00000512863 1461 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 C19orf66-209ENST00000591813 1481 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 CYP2D7-203ENST00000433992 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 CYP2D7-207ENST00000612115 1734 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 ATP6V1G2-205ENST00000303892 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 LINC02028-204ENST00000449350 1419 ntTSL 3 BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 PPP1R16A-202ENST00000435887 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 AKR1A1-201ENST00000351829 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
PIK3C3Q8NEB9 ABHD17AP1-201ENST00000358206 933 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.4 ms