Protein–RNA interactions for Protein: Q8NC06

ACBD4, Acyl-CoA-binding domain-containing protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACBD4Q8NC06 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 FBXL16-203ENST00000562563 2257 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 MTFR1L-202ENST00000374301 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 SYBU-232ENST00000533171 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 MELTF-202ENST00000296351 1650 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 TMEM70-201ENST00000312184 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 AKT1-211ENST00000554848 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 CHTOP-204ENST00000368694 2096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 L2HGDH-203ENST00000421284 1958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 EHMT1-203ENST00000460843 5137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 DBN1-210ENST00000512501 1878 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 UPK3B-201ENST00000257632 1296 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 MARC2-202ENST00000366913 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 LMCD1-AS1-204ENST00000446281 932 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 KRT17P6-201ENST00000453795 1220 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 SDHD-206ENST00000528182 754 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 RN7SL510P-201ENST00000581311 263 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 NTF4-201ENST00000593537 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 REXO2-220ENST00000611665 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 TMEM175-220ENST00000515740 1514 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 RELB-201ENST00000221452 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 GMPPA-203ENST00000358215 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 UBE2Q2-208ENST00000569423 2969 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 EGLN2-201ENST00000303961 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 TINAGL1-202ENST00000457433 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 ENOPH1-203ENST00000509635 1874 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 SPRYD7-204ENST00000613924 2285 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 PRR5-ARHGAP8-201ENST00000352766 2043 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 PPP1R3F-202ENST00000376188 2443 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 SLC25A3-201ENST00000188376 1909 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 MALT1-202ENST00000348428 9368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 TMEM206-201ENST00000261455 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 KCNK4-202ENST00000422670 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 PDLIM4-202ENST00000379018 1006 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 CRELD2-204ENST00000407217 1230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 MCFD2-203ENST00000409147 671 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 DMKN-212ENST00000443640 842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 VCX3A-203ENST00000612369 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 GORASP1-206ENST00000422110 2523 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 ART1-201ENST00000250693 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 BBC3-201ENST00000300880 1347 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 SOWAHC-201ENST00000356454 4657 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 FIP1L1-202ENST00000337488 2198 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 ISLR2-202ENST00000419208 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 ACVR1B-203ENST00000426655 1782 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 RAB4A-201ENST00000366690 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 ZFAND2A-201ENST00000316495 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 GABBR1-202ENST00000376977 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 ZFAND2A-203ENST00000401903 968 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 YPEL5-205ENST00000402708 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 KRTCAP3-202ENST00000407293 942 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 NSMAF-202ENST00000427130 3371 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 LAMTOR4-205ENST00000468582 621 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
ACBD4Q8NC06 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.2 ms