Protein–RNA interactions for Protein: Q8N2S1

LTBP4, Latent-transforming growth factor beta-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,624 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LTBP4Q8N2S1 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 UPF3A-201ENST00000351487 2235 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 LAYN-202ENST00000375615 1836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 SACM1L-202ENST00000418611 2164 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 TMEM163-201ENST00000281924 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 GNB3-201ENST00000229264 1923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 AC110285.2-201ENST00000571724 1565 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 ADCK2-201ENST00000072869 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 INGX-202ENST00000489074 768 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 CD4-210ENST00000541982 1187 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 FAM151B-201ENST00000282226 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 TSPAN4-204ENST00000397404 1462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 ADIRF-201ENST00000372013 917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 AL359764.1-201ENST00000444330 504 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 FAM72B-205ENST00000471903 676 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 TMPRSS5-209ENST00000544634 1524 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.67
LTBP4Q8N2S1 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 ZNF821-221ENST00000611294 1833 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 AF106564.1-201ENST00000607058 2553 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 SLC6A18-201ENST00000324642 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 AP006284.1-201ENST00000527620 2210 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 FOXD4L3-201ENST00000342833 2039 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 UBAP1-204ENST00000625521 2029 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 OPN1LW-201ENST00000369951 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 CIRBP-204ENST00000585630 870 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 SMTNL2-202ENST00000389313 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 LHX2-201ENST00000373615 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 USP39-203ENST00000409470 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 ABHD14B-202ENST00000361143 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 HIKESHI-207ENST00000533986 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 THTPA-202ENST00000404535 1779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 RNF135-201ENST00000324689 1905 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 NCLN-205ENST00000590671 2070 ntTSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 CREG1-201ENST00000370509 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 AL022341.1-201ENST00000455294 389 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 AC084346.2-201ENST00000607097 949 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
LTBP4Q8N2S1 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.7 ms