Protein–RNA interactions for Protein: Q8IZU3

SYCP3, Synaptonemal complex protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYCP3Q8IZU3 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 HSPB8-201ENST00000281938 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 HYOU1-212ENST00000532519 2162 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 PAX1-201ENST00000398485 2838 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 AC099343.3-201ENST00000605834 2503 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 SAMD14-203ENST00000503131 1938 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 OXSR1-201ENST00000311806 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 WFDC1-203ENST00000568638 1319 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 ZNF74-203ENST00000403682 2789 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 SIGIRR-202ENST00000397632 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 EFS-201ENST00000216733 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 XKR6-203ENST00000416569 3382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 IGFBP4-201ENST00000269593 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 RPS6KA3-201ENST00000379565 7918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 RGS9BP-201ENST00000334176 2894 ntAPPRIS P1 BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 CPSF3-201ENST00000238112 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 FAM110A-203ENST00000381939 1737 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 EI24-201ENST00000278903 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 NIPAL2-202ENST00000430223 4496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 CAPN10-203ENST00000352879 862 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 NEUROD2-201ENST00000302584 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 CBX2-202ENST00000310942 4644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 FAM206A-201ENST00000322940 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 TUBA3C-201ENST00000400113 1551 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 KLHL40-201ENST00000287777 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 SEMA3B-202ENST00000418576 1765 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 KRT8-216ENST00000552551 2126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 ASIC3-202ENST00000349064 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 MARK2-211ENST00000513765 2671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 SEC1P-202ENST00000473944 940 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 PRSS23-201ENST00000280258 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
SYCP3Q8IZU3 CASP16P-202ENST00000575497 2161 ntTSL 2 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.7 ms