Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z739

YTHDF3, YTH domain-containing family protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YTHDF3Q7Z739 CBX1-201ENST00000225603 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
YTHDF3Q7Z739 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC18.27■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 MEI1-215ENST00000540833 2326 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 C1orf210-202ENST00000523677 1478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 PCCB-208ENST00000468777 1877 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 DRC3-201ENST00000313838 2064 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 TMUB2-212ENST00000589785 1918 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 GLI4-202ENST00000344692 1012 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 RBP4-201ENST00000371464 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 LYRM9-201ENST00000379102 501 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 ABHD14A-204ENST00000491470 674 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 AL731577.2-201ENST00000508096 555 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 LYRM9-206ENST00000508862 807 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 NCAPD3-204ENST00000526422 1060 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 NMRAL1-212ENST00000574425 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 SEPT2-208ENST00000407971 3267 ntTSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 AGGF1P2-201ENST00000426656 2106 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 RAB11FIP2-201ENST00000355624 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 RBBP7-203ENST00000380087 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 UMOD-205ENST00000570689 2315 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 CREB3L1-206ENST00000621158 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 HCG11-201ENST00000411553 5696 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 CXorf38-202ENST00000378421 2380 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 LINC01505-207ENST00000637185 1540 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 YKT6-201ENST00000223369 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 ANXA8-202ENST00000583448 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 AL365232.1-201ENST00000423730 1636 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 RPLP0-201ENST00000228306 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 LINC00595-207ENST00000476909 792 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 AP005205.2-201ENST00000577327 491 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 F2RL3-202ENST00000599210 613 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 AL136982.7-201ENST00000609363 465 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 ORAOV1-206ENST00000536870 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 SOX30-202ENST00000311371 2716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 AXIN1-201ENST00000262320 3643 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 PDLIM3-202ENST00000284770 1766 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 MAN2C1-244ENST00000618257 1346 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 MYOC-201ENST00000037502 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 PHF20L1-220ENST00000622263 3375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 SAMD11-214ENST00000618323 2159 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 AVPR1A-201ENST00000299178 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 DMKN-201ENST00000339686 1927 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 DACH1-202ENST00000613252 5233 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 CCDC74B-203ENST00000409128 789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 LINC01117-201ENST00000443670 699 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 SCO2-203ENST00000535425 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 TMEM263-203ENST00000547242 811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 TMEM91-203ENST00000392002 1389 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 MAPK9-207ENST00000452135 4815 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 CD247-202ENST00000392122 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
YTHDF3Q7Z739 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.5 ms