Protein–RNA interactions for Protein: Q7Z404

TMC4, Transmembrane channel-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 712 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMC4Q7Z404 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 NHLRC1-201ENST00000340650 2248 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 GJB3-202ENST00000373366 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 BID-204ENST00000399767 2129 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 AC136604.3-201ENST00000508188 429 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 AC026336.2-201ENST00000563922 763 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 AC148477.8-201ENST00000624298 468 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 C19orf25-202ENST00000436106 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 CCND3-204ENST00000414200 1724 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 CLDND1-203ENST00000394181 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 SLC34A3-201ENST00000361134 2124 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 ACBD4-204ENST00000431281 2026 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 FGF2-202ENST00000608478 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 CPZ-201ENST00000315782 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 SLC25A1P1-201ENST00000528351 927 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 RNPS1-222ENST00000567147 830 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 CTDP1-208ENST00000613122 5866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 FAM9A-202ENST00000543214 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 DNAJC28-203ENST00000402202 1480 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 TUBA3FP-202ENST00000422086 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 SERPINH1-215ENST00000533603 2299 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 MRPL52-202ENST00000355151 1118 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 PITPNA-AS1-201ENST00000425081 542 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 HOXA11-AS1_5.1-201ENST00000620211 203 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 GRK4-203ENST00000398052 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 SPOCK3-204ENST00000502330 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 TMEM106C-202ENST00000429772 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 ACD-201ENST00000219251 2052 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 HPS6-201ENST00000299238 2649 ntAPPRIS P1 BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 ENGASE-205ENST00000579016 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 CDH5-204ENST00000563425 1932 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 PARP2-202ENST00000429687 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 CLDN14-203ENST00000399136 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
TMC4Q7Z404 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 RPS2P28-201ENST00000314255 741 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 MSRB1-202ENST00000399753 847 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 RPP21-221ENST00000428040 594 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 RPP21-224ENST00000442966 525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
TMC4Q7Z404 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.6 ms