Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU9

STRC, Stereocilin, humanhuman

Predictions only

Length 1,775 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
STRCQ7RTU9 ADH5P3-201ENST00000433842 1137 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 AC005544.2-201ENST00000579138 229 ntTSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 KCNK4-207ENST00000539216 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 KLRG2-201ENST00000340940 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 MRM3-201ENST00000304478 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 SHMT1-202ENST00000352886 2437 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 AL022326.1-202ENST00000641533 845 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 PDGFA-201ENST00000354513 1308 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 TEAD2-201ENST00000311227 2164 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 AC007952.1-201ENST00000399087 553 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 AC007952.2-202ENST00000399093 556 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 AC106017.2-202ENST00000628484 536 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
STRCQ7RTU9 THOC7-201ENST00000295899 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 GPR148-201ENST00000309926 1267 ntAPPRIS P1 BASIC25.89■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 AL807752.4-201ENST00000439076 580 ntTSL 2 BASIC25.89■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 FAM86GP-201ENST00000448322 971 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC25.89■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 TK1-204ENST00000590430 683 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 C17orf58-204ENST00000580729 2065 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 Z98044.1-201ENST00000632503 1764 ntBASIC25.89■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 MAP3K11-210ENST00000532507 1812 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 HYAL1-203ENST00000395143 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 FAM129C-212ENST00000601861 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 GUK1-203ENST00000366718 1275 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 HLA-DRB6-201ENST00000411500 1235 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 ATG10-207ENST00000513443 978 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 AC015911.4-201ENST00000588022 1070 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 AC010336.3-201ENST00000597156 667 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 DNAAF3-202ENST00000455045 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 RTN1-202ENST00000342503 1703 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 FAM187A-202ENST00000412523 1748 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 NNT-AS1-206ENST00000606697 1945 ntTSL 2 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 NOTUM-201ENST00000409678 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 UBXN6-201ENST00000301281 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 AL137002.2-201ENST00000639766 2238 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 NR2F1-205ENST00000615873 1427 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 IL4I1-202ENST00000391826 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 HPCA-201ENST00000373467 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 P2RY6-201ENST00000349767 1700 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 ZEB1-AS1-209ENST00000607455 559 ntTSL 4 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 ESRRA-202ENST00000405666 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 STAU2-229ENST00000524300 3065 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 SPOCK3-217ENST00000511269 1768 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 PPT2-244ENST00000324816 2053 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 PRKAG2-AS1-202ENST00000467458 1064 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 ALDH7A1-215ENST00000553117 1935 ntTSL 2 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 RUFY1-201ENST00000319449 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 C17orf67-201ENST00000397861 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 UAP1-201ENST00000271469 2377 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.86■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 ULK3-217ENST00000568667 1470 ntTSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 AC091812.2-201ENST00000619081 385 ntBASIC25.85■■□□□ 1.73
STRCQ7RTU9 CHADL-201ENST00000216241 2533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 64 ms