Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTU4

BHLHA9, Class A basic helix-loop-helix protein 9, humanhuman

Predictions only

Length 235 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BHLHA9Q7RTU4 NPAP1P7-201ENST00000613027 823 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AP001476.1-201ENST00000451618 2198 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 LINC00167-201ENST00000530583 1419 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AC090164.3-201ENST00000610780 2143 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 DARS-AS1-202ENST00000419808 772 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 TSPY22P-201ENST00000427496 604 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 CBR1-203ENST00000439427 1024 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 IGFLR1-209ENST00000592537 1195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 RABAC1-208ENST00000601078 728 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 NUMBL-207ENST00000598779 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 BANP-202ENST00000355022 2164 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 DOCK9-206ENST00000427887 4176 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 GLYCTK-201ENST00000305690 1371 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 ZNF598-204ENST00000563630 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 MYEOV-201ENST00000308946 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AMACR-205ENST00000426255 1316 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 SOD2-206ENST00000452684 2045 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 VOPP1-201ENST00000285279 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 FAM53C-211ENST00000513056 923 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 VEGFA-222ENST00000520948 1199 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AC009084.1-201ENST00000566869 317 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 C10orf142-202ENST00000623589 1010 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 MCTP2-205ENST00000543482 1422 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 POLR2C-201ENST00000219252 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 PACRGL-203ENST00000444671 1720 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 TPCN2-201ENST00000294309 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 COPS7A-215ENST00000543155 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 KANSL1L-203ENST00000418791 3562 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 ELANE-201ENST00000263621 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 MED30-201ENST00000297347 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 UNKL-202ENST00000301712 1431 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AP003774.1-201ENST00000316124 2340 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 CDH22-201ENST00000372262 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 BID-205ENST00000399774 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 ING5-202ENST00000406941 946 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 CLK1-205ENST00000434813 2026 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 RAB6A-207ENST00000541588 758 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 ANAPC11-217ENST00000579978 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AC069148.1-201ENST00000608741 768 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 KCNN4-209ENST00000615047 2029 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
BHLHA9Q7RTU4 LEMD2-201ENST00000293760 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.9 ms