Protein–RNA interactions for Protein: Q7RTS3

PTF1A, Pancreas transcription factor 1 subunit alpha, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTF1AQ7RTS3 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 ICAM2-205ENST00000578379 1064 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 ICAM2-206ENST00000578892 1056 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 COPE-211ENST00000600932 1144 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 LINC00304-201ENST00000321214 2243 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 UBE2F-205ENST00000414443 2100 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 EEF1A2-201ENST00000217182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 P3H4-202ENST00000393928 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 ALDH2-202ENST00000416293 1572 ntTSL 2 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 FAM129C-205ENST00000595684 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 DBNL-213ENST00000452943 1513 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 RPS29-206ENST00000557111 488 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 AL139288.1-201ENST00000623748 933 ntBASIC23.56■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 LY6E-207ENST00000520466 1419 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 MEN1-206ENST00000377321 2614 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 C5orf30-203ENST00000515669 1573 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 BEAN1-202ENST00000536005 1988 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 DRD2-202ENST00000362072 2789 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 SLC25A41-201ENST00000321510 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 TPBGL-201ENST00000562197 2793 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 DPH1-201ENST00000263083 2221 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 DIO1-201ENST00000322679 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 DIO1-217ENST00000617230 1656 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 BLOC1S2-202ENST00000370372 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 SWI5-205ENST00000495313 466 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 MRFAP1-203ENST00000507420 563 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 COX5A-206ENST00000568783 571 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 AC092364.2-202ENST00000597012 1073 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 ADGRA3-204ENST00000502482 2870 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 PRR23B-201ENST00000329447 1896 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 FIP1L1-207ENST00000507922 1335 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 LINC01006-201ENST00000333319 2292 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 PIF1-202ENST00000333425 2278 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 P2RY6-203ENST00000393591 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 PORCN-205ENST00000367574 1368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 PORCN-214ENST00000537758 1371 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 FADS2-209ENST00000521849 1703 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 FAM3C-201ENST00000359943 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 GALNS-201ENST00000268695 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 TECR-201ENST00000215567 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 PON3-203ENST00000427422 894 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 LINC02199-203ENST00000510229 496 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 AC018529.2-201ENST00000612024 828 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 SLC39A5-209ENST00000454355 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PTF1AQ7RTS3 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms