Protein–RNA interactions for Protein: Q712K3

UBE2R2, Ubiquitin-conjugating enzyme E2 R2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 238 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBE2R2Q712K3 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 TCTN1-225ENST00000551590 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 HNRNPM-201ENST00000325495 2494 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 CDK13-201ENST00000181839 7298 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 CUTC-202ENST00000370476 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 ZNF395-211ENST00000523202 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 CPXM2-204ENST00000615851 2512 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 TMEM88B-201ENST00000378821 492 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 TRIM73-205ENST00000450434 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 GMDS-208ENST00000530927 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 AC024243.1-201ENST00000609234 778 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 OBP2B-205ENST00000618116 961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 THOP1-201ENST00000307741 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
UBE2R2Q712K3 TESMIN-201ENST00000255087 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 PLPP4-202ENST00000398250 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 C22orf39-205ENST00000542103 1523 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 CCNJ-203ENST00000465148 2677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 FOXP1-214ENST00000493089 2703 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 CHRNB1-201ENST00000306071 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 AL162741.1-201ENST00000565563 1558 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 HTR7P1-202ENST00000624664 4411 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 VKORC1-202ENST00000319788 1077 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 TMUB1-205ENST00000482202 899 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 SLC39A11-207ENST00000579732 1004 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 NUDT16L1-203ENST00000586252 922 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 PTGIR-204ENST00000596260 1009 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 HERPUD2-201ENST00000311350 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 NCF1B-201ENST00000423083 1516 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 MYOZ3-203ENST00000517768 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 GABBR1-204ENST00000377016 4299 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 PLK1-201ENST00000300093 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 CCDC43-201ENST00000315286 2082 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 LINC00461-203ENST00000504246 2300 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 JPH2-201ENST00000342272 1923 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 DPAGT1-203ENST00000409993 3274 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 MRAS-204ENST00000464896 1534 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 PPP1R7-201ENST00000234038 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 TSPY8-202ENST00000383000 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 TSPY2-202ENST00000383042 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 TSPY3-201ENST00000424594 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 LIN28AP1-201ENST00000429574 405 ntBASIC18■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 TSPY10-202ENST00000444056 1125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
UBE2R2Q712K3 AC009065.1-201ENST00000564055 1225 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms