Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL3

USP50, Inactive ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 50, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 339 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP50Q70EL3 PGM5P2-202ENST00000637225 1043 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
USP50Q70EL3 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP50Q70EL3 NFE2L1-204ENST00000536222 2172 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP50Q70EL3 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP50Q70EL3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP50Q70EL3 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP50Q70EL3 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
USP50Q70EL3 S1PR5-201ENST00000333430 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP50Q70EL3 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP50Q70EL3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
USP50Q70EL3 PWWP2AP1-201ENST00000429776 2273 ntBASIC21.64■■□□□ 1.06
USP50Q70EL3 MUTYH-203ENST00000372098 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP50Q70EL3 MUTYH-204ENST00000372104 1823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP50Q70EL3 MUTYH-205ENST00000372110 1809 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP50Q70EL3 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP50Q70EL3 DNAAF3-207ENST00000527223 2228 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP50Q70EL3 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP50Q70EL3 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
USP50Q70EL3 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 TSPO-202ENST00000337554 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 COLEC11-207ENST00000404205 1062 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 AC092667.1-201ENST00000434301 2586 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 SPHK1-203ENST00000545180 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 RDH13-203ENST00000415061 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 PPA2-202ENST00000348706 1414 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 CYP21A1P-201ENST00000342991 1971 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 SIX5-203ENST00000560168 1975 ntTSL 4 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 ILDR2-207ENST00000529071 2566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 NXPH2-201ENST00000272641 1052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 LCE1D-201ENST00000326233 430 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 FBLN5-202ENST00000342058 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 TOR3A-201ENST00000352445 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 AL645939.2-201ENST00000427340 991 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 COX5A-202ENST00000562233 441 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 FAM129C-208ENST00000599164 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 NRN1-204ENST00000622188 1795 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 AC107959.1-202ENST00000502083 1945 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 GAS7-205ENST00000542249 1799 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 HOXD10-201ENST00000249501 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 CD9-202ENST00000382515 1229 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 C7orf49-202ENST00000424142 1738 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 UBL4A-202ENST00000369660 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 TULP1-208ENST00000614066 2084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 MIR4469-201ENST00000583919 79 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 POLR2M-206ENST00000494490 1648 ntTSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 C16orf70-208ENST00000569600 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 FBXO27-201ENST00000292853 2330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 PARS2-201ENST00000371279 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 H2AFZ-201ENST00000296417 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 MCFD2-205ENST00000409218 648 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
USP50Q70EL3 KRT18P27-201ENST00000427733 1299 ntBASIC21.6■■□□□ 1.05
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