Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZSS7

MFSD6, Major facilitator superfamily domain-containing protein 6, humanhuman

Predictions only

Length 791 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MFSD6Q6ZSS7 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 FKBP3-201ENST00000216330 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 VENTXP5-201ENST00000523979 775 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 TPM1-226ENST00000560959 925 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 AC064853.5-201ENST00000641976 258 ntAPPRIS P1 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 FAM3A-201ENST00000322269 1815 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 CERS5-203ENST00000422340 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 ULK2-201ENST00000361658 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 WDR45-205ENST00000376358 1432 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 ALKBH4-201ENST00000292566 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 NFATC2IP-201ENST00000320805 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 BRPF3-202ENST00000357641 6052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 CABP7-201ENST00000216144 3259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 TMEM129-202ENST00000382936 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 CDKN2C-201ENST00000262662 2904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 FAM187B-201ENST00000324675 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 EEF1D-202ENST00000395119 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 AP002807.1-202ENST00000526897 791 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 AL136038.3-201ENST00000561909 1096 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 TULP1-201ENST00000229771 2162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 CACNA1A-218ENST00000635895 8657 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 CACNA1A-257ENST00000638009 8665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 ECEL1-201ENST00000304546 2865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 NUDT4-202ENST00000415493 4839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 CD1E-210ENST00000368165 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 CD1E-214ENST00000452291 745 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 GFOD2-207ENST00000602855 819 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 DHRS4L2-201ENST00000335125 1370 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 COQ9-210ENST00000567072 1482 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 LIN28B-AS1-203ENST00000636682 1797 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 IL1R1-205ENST00000410023 5143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 PCDHB2-202ENST00000622947 2231 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 ANKRD18DP-201ENST00000335478 2171 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 SIL1-202ENST00000394817 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 THNSL2-205ENST00000449349 1616 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 AGPAT2-201ENST00000371694 1391 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 GOLGA2P10-204ENST00000618004 1349 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 GPX4-201ENST00000354171 919 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 TBC1D7-205ENST00000379307 1084 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 MIR662-201ENST00000384847 95 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 RBPMS-AS1-202ENST00000519753 1031 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 AKTIP-212ENST00000570004 1162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
MFSD6Q6ZSS7 AC010422.3-201ENST00000597692 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms