Protein–RNA interactions for Protein: Q6UXN2

TREML4, Trem-like transcript 4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 200 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TREML4Q6UXN2 NR4A1-203ENST00000394824 2639 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 AC068446.2-201ENST00000500487 2165 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 ISCU-201ENST00000311893 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 CD70-202ENST00000423145 881 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 RN7SL275P-201ENST00000582762 335 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 SMAGP-206ENST00000604188 433 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 mascRNA-menRNA.2-201ENST00000616984 58 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 AC131212.4-201ENST00000623606 975 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 AL772307.1-201ENST00000639363 1066 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 SLC3A2-202ENST00000377889 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 TMPRSS5-205ENST00000538955 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 SERPINA4-201ENST00000298841 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 CARNS1-205ENST00000531040 2968 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 TPD52-211ENST00000519303 1594 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 CRELD2-201ENST00000328268 1357 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 ATP1B1-202ENST00000367816 2608 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 TRMU-202ENST00000381019 1381 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 BEGAIN-211ENST00000637646 2911 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 MYC-205ENST00000524013 2150 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 KRT14-201ENST00000167586 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 RIPK2-201ENST00000220751 2584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 AP5S1-202ENST00000379567 1791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 SNRPN-207ENST00000554227 1763 ntTSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 CD72-201ENST00000259633 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 NFE2-204ENST00000553070 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 PTPA-206ENST00000358994 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 KRTAP5-3-201ENST00000399685 899 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 IMP3-202ENST00000403490 1237 ntAPPRIS P1 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 FDX2-206ENST00000492239 773 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 CLIP2-201ENST00000223398 5563 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 PLA2G2F-201ENST00000375102 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 AGO4-201ENST00000373210 7116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 SYTL1-201ENST00000318074 1900 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 SRSF2-202ENST00000359995 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 ATRIP-202ENST00000346691 2509 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 ADRA1A-201ENST00000276393 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 FBXL18-205ENST00000620087 2076 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 IFNLR1-202ENST00000327575 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 ZNF419-204ENST00000415379 2186 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 KLHL14-201ENST00000358095 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0.01
TREML4Q6UXN2 TRIM47-201ENST00000254816 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 PLEKHB1-203ENST00000398492 2275 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 SCD5-201ENST00000273908 1995 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 ANKRD6-202ENST00000369408 5258 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 PXMP4-201ENST00000217398 979 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 SUMF2-203ENST00000395435 1287 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 AC016065.1-203ENST00000523225 1017 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 AC083906.6-201ENST00000641366 219 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 FADS1-204ENST00000433932 1690 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 ZNF787-202ENST00000587279 1657 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 PPHLN1-213ENST00000549190 1777 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 SLC39A7-201ENST00000374675 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 AC135782.1-201ENST00000537498 2154 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 KCNC4-203ENST00000413138 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 GSEC-201ENST00000626810 2289 ntTSL 2 BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 ACY1-201ENST00000404366 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 GNAS-AS1-202ENST00000443966 2341 ntTSL 5 BASIC15.08■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 CD151-201ENST00000322008 1548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
TREML4Q6UXN2 SLC22A18-202ENST00000347936 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.07■□□□□ 0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms