Protein–RNA interactions for Protein: Q6UWL2

SUSD1, Sushi domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 747 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SUSD1Q6UWL2 SERPINE2-201ENST00000258405 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 ADARB1-201ENST00000348831 6882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 NUDT16L1-201ENST00000304301 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 TYMS-201ENST00000323224 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 PRKCI-201ENST00000295797 4950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 HCLS1-201ENST00000314583 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 WDSUB1-203ENST00000392796 1812 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 FMR1-206ENST00000370477 3437 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 DUS1L-202ENST00000354321 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 MAPK8IP3-216ENST00000610761 5626 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 OCIAD2-201ENST00000273860 636 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 NDUFS3-213ENST00000534716 1263 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 AC011773.3-202ENST00000549291 790 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 OCIAD2-210ENST00000620187 697 ntTSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 AC112497.1-201ENST00000624824 639 ntBASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 SCPEP1-216ENST00000631024 444 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 EEF1D-205ENST00000442189 2207 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 BIRC8-201ENST00000426466 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
SUSD1Q6UWL2 WDTC1-201ENST00000319394 4819 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 FDXR-214ENST00000581530 1827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 RBM7-201ENST00000375490 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 RARRES1-201ENST00000237696 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 PCDHA1-202ENST00000394633 2204 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 ZNF419-207ENST00000442920 1857 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 AC007743.1-203ENST00000447423 1623 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 P2RX2-208ENST00000542301 1881 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 AC007040.2-201ENST00000606025 4170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 BDKRB1-202ENST00000553356 1526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 DACT2-201ENST00000366795 2942 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 FAM213B-202ENST00000378425 2665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 CD7-201ENST00000312648 1281 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 ROMO1-202ENST00000374072 350 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 GAD2-202ENST00000376248 680 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 NDUFV2-207ENST00000497577 868 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 FOSL1-203ENST00000531493 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 ZCCHC17-205ENST00000615916 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 HCK-202ENST00000375852 2082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 NOC2LP1-202ENST00000452600 2235 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 VPS37B-201ENST00000267202 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 PTGES2-214ENST00000617202 1344 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 PTPA-223ENST00000452489 2526 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 KANK4-204ENST00000371153 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 PDE4A-202ENST00000344979 2579 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 RSPO4-201ENST00000217260 2707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 SYNM-204ENST00000594047 6407 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 PRDM12-201ENST00000253008 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 ZNF385A-202ENST00000352268 2076 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 STK25-203ENST00000403346 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 SPERT-202ENST00000378966 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 EMC8-201ENST00000253457 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 AL133373.2-201ENST00000623187 2828 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 BOLA3-202ENST00000327428 639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 TPSB2-201ENST00000606293 1165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SUSD1Q6UWL2 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.9 ms