Protein–RNA interactions for Protein: Q6TFL3

CCDC171, Coiled-coil domain-containing protein 171, humanhuman

Predictions only

Length 1,326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC171Q6TFL3 MIR3917-201ENST00000580971 93 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 AL031432.5-201ENST00000641059 760 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 CPAMD8-202ENST00000388925 5355 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 PRDX3-201ENST00000298510 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 ALDH3B1-206ENST00000615463 1300 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 TTC22-201ENST00000371274 2149 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 ESPNP-201ENST00000270691 2015 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 TCF25-225ENST00000614813 2047 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 LONP1-201ENST00000360614 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 SSUH2-202ENST00000341795 1799 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 ASB7-203ENST00000558747 2133 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 NFIX-202ENST00000360105 5459 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 AC135776.1-201ENST00000319817 2481 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 SMPD1-201ENST00000342245 2452 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 SYT3-206ENST00000600079 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 PIP4K2C-202ENST00000422156 1558 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 FGF8-201ENST00000320185 799 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 MIR149-201ENST00000384879 89 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 AC003075.1-204ENST00000433005 540 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 AC011498.2-201ENST00000588798 540 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 AC140113.3-201ENST00000605663 199 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 SNX11-201ENST00000359238 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 EGFL6-201ENST00000361306 2398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 AC087500.1-202ENST00000571689 1715 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 MRPS7-204ENST00000579761 1717 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 TMPRSS12-201ENST00000398458 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 KRT86-202ENST00000423955 2217 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 PKN1-201ENST00000242783 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 CIZ1-226ENST00000629610 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 TMPOP1-202ENST00000424642 1267 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 AC104076.2-201ENST00000448912 469 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 REEP1-207ENST00000535845 1196 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 AC007613.1-201ENST00000572811 2597 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 PRSS12-201ENST00000296498 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 ASCL5-202ENST00000458416 1420 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 BMP2K-208ENST00000628286 3848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 APAF1-210ENST00000551964 5444 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 KIF26A-202ENST00000423312 5649 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 PTPA-201ENST00000337738 2845 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 RRP7BP-201ENST00000357802 2375 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 RIMBP3B-201ENST00000620804 6105 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 AC093677.2-201ENST00000600169 1863 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 AC021739.3-201ENST00000557908 855 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 AC015961.2-201ENST00000589281 701 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 NECTIN1-201ENST00000264025 5840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 HYAL1-204ENST00000395144 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 ITPK1-202ENST00000354313 2803 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 ZDHHC14-203ENST00000359775 7380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
CCDC171Q6TFL3 CDAN1-201ENST00000356231 4637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.5 ms