Protein–RNA interactions for Protein: Q6PL18

ATAD2, ATPase family AAA domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATAD2Q6PL18 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.31■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 GHDC-212ENST00000593209 1827 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 ZNF331-214ENST00000511154 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 FBLN7-202ENST00000331203 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 PMS1-222ENST00000639501 2506 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 TPCN2-208ENST00000637342 2856 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 RHOV-201ENST00000220507 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 S100A16-204ENST00000368706 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 BET1L-206ENST00000486280 665 ntTSL 3 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 MGAT5B-209ENST00000569840 4492 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 HOXC10-201ENST00000303460 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 COBL-210ENST00000632460 1941 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 IDH3G-202ENST00000370092 1712 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 MEPCE-202ENST00000414441 2261 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 PNOC-201ENST00000301908 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 MOK-208ENST00000519058 917 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 C19orf25-204ENST00000586564 1265 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 AC099336.1-202ENST00000602961 463 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 PRPS1-203ENST00000372428 1748 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 ANXA3-201ENST00000264908 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 RGS11-204ENST00000397770 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 DRAP1-202ENST00000376991 819 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 MCFD2-208ENST00000409973 821 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 PEPD-203ENST00000436370 1638 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 SEMA3D-202ENST00000444867 1605 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 ARHGEF4-202ENST00000355771 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 DOK1-201ENST00000233668 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 ZNF579-201ENST00000325421 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 NEIL3-201ENST00000264596 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 TFF3-201ENST00000291525 407 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 HAGH-208ENST00000566709 1291 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 SEC11C-205ENST00000588875 718 ntTSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
ATAD2Q6PL18 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAD2Q6PL18 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAD2Q6PL18 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAD2Q6PL18 DGKZ-203ENST00000421244 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAD2Q6PL18 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAD2Q6PL18 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
ATAD2Q6PL18 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.2 ms