Protein–RNA interactions for Protein: Q6PK04

CCDC137, Coiled-coil domain-containing protein 137, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC137Q6PK04 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 STXBP2-203ENST00000441779 1914 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 EDC3-214ENST00000568176 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 MAPT-209ENST00000446361 5345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 PODN-203ENST00000395871 2744 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 MRPL3-202ENST00000425847 1457 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 FAM98C-201ENST00000252530 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 SNCG-201ENST00000348795 684 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 GUK1-209ENST00000366730 937 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 AP000593.1-201ENST00000393668 712 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 AC011506.1-201ENST00000474329 610 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 SPINK2-202ENST00000504762 659 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 JPT2-204ENST00000561516 1065 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 EFHC1-206ENST00000635760 2030 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 PSRC1-205ENST00000409138 1826 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 C1orf159-205ENST00000421241 1841 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 GMCL1P1-201ENST00000463439 1581 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 NUDT17-201ENST00000334513 1473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 PRSS50-202ENST00000315170 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 PTPDC1-202ENST00000375360 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 BIK-201ENST00000216115 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 PUSL1-201ENST00000379031 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 MIR564-202ENST00000385049 94 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 FLYWCH2-202ENST00000396958 1036 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 MTFP1-203ENST00000407550 912 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 SMAD7-207ENST00000589634 1278 ntAPPRIS ALT1 TSL 4 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 ZNF667-AS1-208ENST00000594783 475 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 STK10-201ENST00000176763 6060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 NUDT19-201ENST00000397061 2967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 LEMD2-214ENST00000614475 2883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 SLC25A29-215ENST00000556505 1540 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 FAM99A-201ENST00000382167 1432 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 NOL4-211ENST00000589544 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 PPT2-247ENST00000375143 1754 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 AC120049.1-201ENST00000592638 2065 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 ABCC5-211ENST00000446941 883 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 BABAM1-202ENST00000447614 930 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 NDUFAF3-204ENST00000451378 774 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 B3GAT3P1-201ENST00000471720 806 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 PSMB5-205ENST00000493471 1117 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 AC004771.5-201ENST00000575985 542 ntTSL 4 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 MIR6786-201ENST00000616843 113 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 RTKN-203ENST00000305557 2646 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 CHTOP-205ENST00000403433 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 BIN1-208ENST00000376113 1832 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 ETV2-203ENST00000402764 1487 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 CPAMD8-203ENST00000443236 5992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 TMEM183A-201ENST00000367242 3019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 NOMO3-201ENST00000263012 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 TRAPPC2L-201ENST00000301021 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 FAM118A-202ENST00000405673 1612 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 DTX2-202ENST00000413936 2472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
CCDC137Q6PK04 METTL21A-201ENST00000272839 1210 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 AC007493.2-201ENST00000568427 478 ntTSL 3 BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 AF186192.3-201ENST00000583427 947 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 QKI-205ENST00000392127 7911 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
CCDC137Q6PK04 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.7 ms