Protein–RNA interactions for Protein: Q6PB30

CSAG1, Putative chondrosarcoma-associated gene 1 protein, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSAG1Q6PB30 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 WWTR1-AS1-203ENST00000495094 975 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 EGFEM1P-209ENST00000502332 728 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AC008443.6-201ENST00000512508 500 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AC022509.3-202ENST00000545819 566 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 BEAN1-AS1-201ENST00000564618 533 ntTSL 4 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 ZNF263-205ENST00000574253 1139 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PLK5-204ENST00000588430 900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 NEDD4L-225ENST00000589054 1033 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 HIST1H2AL-201ENST00000613174 393 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 GGTLC2-204ENST00000613850 973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 GGTLC2-205ENST00000618722 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 FTCDNL1-204ENST00000622774 1997 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 FDFT1-224ENST00000618539 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 DNAJC14-203ENST00000357606 3416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AK4-202ENST00000395334 6998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 OCSTAMP-201ENST00000279028 2043 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 TBC1D9B-201ENST00000355235 5119 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 MAP7D1-203ENST00000373150 3238 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 WSCD1-210ENST00000574946 5884 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SEPT7-206ENST00000435235 1584 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SNX24-211ENST00000513881 1563 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SKP2-208ENST00000546211 1589 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 HNF1B-202ENST00000614313 1819 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 HNF1B-203ENST00000617272 1820 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 MAGED2-203ENST00000375053 2066 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SLC3A2-206ENST00000535296 2084 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 FAM109A-204ENST00000548163 2317 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 RRBP1-204ENST00000377813 5041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PACSIN2-205ENST00000407585 3080 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 TP73-202ENST00000354437 2140 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PTGES2-AS1-201ENST00000443493 2100 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SLC36A1-209ENST00000521925 1621 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 ZNF831-201ENST00000371030 9401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 MEN1-208ENST00000394374 3155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 RBFOX1-215ENST00000553186 2196 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 ABHD1-201ENST00000316470 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 GCLC-201ENST00000229416 3813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 CFP-201ENST00000247153 1713 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 TTLL8-201ENST00000266182 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 TBC1D19-201ENST00000264866 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 CPZ-202ENST00000360986 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PARD3B-204ENST00000406610 8174 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 MIF-AS1-201ENST00000406213 1476 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 BZW1-209ENST00000452790 1473 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 EPN2-212ENST00000575595 1491 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 CHAC1-205ENST00000617961 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PDLIM2-221ENST00000622702 1490 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 TBX6-201ENST00000279386 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 TBX6-205ENST00000627355 1796 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SAMD11-212ENST00000617307 2314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 VWA1-203ENST00000476993 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 DBNL-217ENST00000468694 2068 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AC127496.1-202ENST00000573602 2091 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 EPOR-208ENST00000592375 2086 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 TOR2A-203ENST00000373284 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 DISC1-209ENST00000439617 7059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AIFM2-201ENST00000307864 3243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 EPHA8-201ENST00000166244 4943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 H2AFV-201ENST00000222690 3804 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 MZB1-201ENST00000302125 825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 RFTN1-201ENST00000334133 2982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 GPR3-201ENST00000374024 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 CYYR1-202ENST00000400043 735 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 PSMB11-201ENST00000408907 2110 ntAPPRIS P1 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 AC012146.1-202ENST00000413077 474 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SERP1-205ENST00000487153 657 ntTSL 4 BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 C5orf38-206ENST00000505778 509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
CSAG1Q6PB30 CTBP1-AS2-203ENST00000507044 739 ntTSL 3 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.5 ms