Protein–RNA interactions for Protein: Q6P5Q4

LMOD2, Leiomodin-2, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMOD2Q6P5Q4 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD2Q6P5Q4 ZNF688-201ENST00000223459 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD2Q6P5Q4 CADPS2-208ENST00000615869 6066 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD2Q6P5Q4 VPS26B-202ENST00000525095 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD2Q6P5Q4 TRMT6-202ENST00000453074 2239 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD2Q6P5Q4 GPR31-201ENST00000366834 2059 ntAPPRIS P1 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD2Q6P5Q4 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD2Q6P5Q4 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD2Q6P5Q4 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD2Q6P5Q4 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD2Q6P5Q4 AC145285.3-201ENST00000564603 959 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
LMOD2Q6P5Q4 CCDC62-204ENST00000392441 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 SEPT4-201ENST00000317256 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 INTS11-249ENST00000618806 1523 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 PTGES2-201ENST00000277462 1614 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 ASB16-201ENST00000293414 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 INTS11-250ENST00000620829 1862 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 ATXN7L2-202ENST00000369870 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 TMEM44-203ENST00000381975 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 SORBS3-221ENST00000523965 2028 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 FBLN1-204ENST00000402984 2355 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 RNPEPL1-201ENST00000270357 5658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 SNHG15-206ENST00000580528 1073 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 IER2-202ENST00000587885 1291 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 LINC01607-201ENST00000607172 621 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 FAM214B-203ENST00000378561 5771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 SUMF2-208ENST00000434526 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 RREB1-201ENST00000334984 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 APBB3-203ENST00000357560 2218 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 DHRS12-201ENST00000218981 1970 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 CAPZB-202ENST00000264203 2068 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 NFKBIZ-201ENST00000326151 2058 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 SPG7-202ENST00000341316 2288 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 ENTPD8-204ENST00000472938 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 FUOM-202ENST00000368551 628 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 LINC01635-202ENST00000635097 1023 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 OTOP3-201ENST00000328801 2363 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 DIAPH1-203ENST00000389057 5762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 TDRP-202ENST00000427263 2465 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 RMND5A-201ENST00000283632 6301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 HNRNPDL-210ENST00000630827 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 MYBPH-201ENST00000255416 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 MRGPRG-AS1-201ENST00000420873 1818 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 PCDHA13-203ENST00000617769 2427 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 RAB11FIP5-201ENST00000258098 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 DLGAP4-204ENST00000373913 5056 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 VPS53-201ENST00000291074 2656 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 ZNF771-201ENST00000319296 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 IRF7-201ENST00000330243 1992 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 LYPD3-201ENST00000244333 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 TICAM1-202ENST00000621756 1650 ntTSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 FAM237A-203ENST00000543490 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 NMU-202ENST00000505262 693 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 RELA-202ENST00000406246 2700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 RTN4RL2-201ENST00000335099 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 CACNA1I-204ENST00000407673 5952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 RDX-202ENST00000405097 2761 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 CBWD2-204ENST00000433343 1411 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 AC125437.2-201ENST00000625180 2167 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 ANKRD65-201ENST00000427211 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 TRABD2A-202ENST00000409133 1554 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 KLHDC1-201ENST00000359332 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 WFIKKN1-201ENST00000319070 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.85■■□□□ 1.57
LMOD2Q6P5Q4 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms