Protein–RNA interactions for Protein: Q6P1Q0

LETMD1, LETM1 domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 360 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LETMD1Q6P1Q0 SLC39A13-212ENST00000531974 856 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 AL353719.1-201ENST00000566847 864 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 ARHGDIA-207ENST00000580685 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 MIR4785-201ENST00000585005 73 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 ADCY6-206ENST00000550422 5877 ntTSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 PGM5-202ENST00000396396 3338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 SLBP-201ENST00000318386 1635 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 OGFOD2-212ENST00000538755 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 TBC1D3I-202ENST00000618620 1900 ntTSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 PARD3-205ENST00000374773 3420 ntTSL 5 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 GPSM2-201ENST00000264126 3032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 TPRA1-204ENST00000450633 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.82■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 HOXA13-201ENST00000222753 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 ETS1-208ENST00000535549 4594 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 SYT17-207ENST00000568115 1721 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 HNRNPK-202ENST00000360384 2038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 SLC23A3-203ENST00000409878 2010 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 HIST1H2APS4-201ENST00000362070 348 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 SHBG-203ENST00000416273 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 AL162231.1-203ENST00000416454 465 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 NDUFB2-203ENST00000461457 559 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 TMEM185A-204ENST00000507237 903 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 DHDH-203ENST00000522614 776 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 TMEM9B-203ENST00000528117 949 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 MLF2-210ENST00000542154 838 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 FITM1-202ENST00000559294 800 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 SHBG-215ENST00000575903 1196 ntTSL 3 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 NAT14-202ENST00000587400 416 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 IRAK3-202ENST00000457197 1853 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 HEXIM2-201ENST00000307275 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 ZSWIM4-201ENST00000254323 4339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 SYT8-202ENST00000381968 1424 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 AC092338.2-201ENST00000568827 1415 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 HOXB1-202ENST00000577092 1414 ntBASIC17.81■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 EVC-201ENST00000264956 6431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 FAM182B-201ENST00000376403 1681 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 ENOPH1-202ENST00000505846 1689 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 SMARCC1-201ENST00000254480 6375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 PPP1R7-207ENST00000407025 1592 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 METTL21A-206ENST00000432416 869 ntTSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 TSPY17P-201ENST00000450329 467 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 AL139246.2-201ENST00000456687 1297 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 AC044860.1-201ENST00000560756 1160 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 AC005943.1-201ENST00000585937 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 JAM2-202ENST00000400532 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 CD19-206ENST00000567541 1707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 NOMO2-201ENST00000330537 4352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 SLX1B-SULT1A4-201ENST00000344620 2424 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 NKD2-202ENST00000296849 2155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 ITGA4-202ENST00000339307 1403 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 TMEM110-MUSTN1-202ENST00000504329 1405 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 NETO1-201ENST00000327305 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 MYO15B-232ENST00000610510 9195 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 PIGQ-203ENST00000321878 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 ZDHHC8P1-204ENST00000433168 2309 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 SCAND1-203ENST00000615116 1371 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 PRMT2-203ENST00000355680 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 PCBP3-205ENST00000400310 2168 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 ACOXL-205ENST00000439055 2373 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
LETMD1Q6P1Q0 RHOG-202ENST00000396978 1066 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms