Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZY7

CDC42EP5, Cdc42 effector protein 5, humanhuman

Predictions only

Length 148 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CDC42EP5Q6NZY7 CD1E-209ENST00000368164 869 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 NRXN2-203ENST00000377551 6373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 PRSS42-201ENST00000429665 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 AC079776.4-201ENST00000511039 504 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 SDR39U1-202ENST00000538105 1041 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 AL662844.1-201ENST00000546340 181 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 LDLRAD4-211ENST00000587757 2171 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 MUS81-201ENST00000308110 2392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 FYTTD1-205ENST00000424384 1758 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 PDZRN4-202ENST00000402685 3347 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 CCDC50-202ENST00000392456 2454 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 CCNA1-202ENST00000440264 1758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 TBXA2R-201ENST00000375190 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 AL022342.1-201ENST00000400363 863 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 PTPN11-207ENST00000639857 801 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 IFIH1-202ENST00000421365 1617 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 FOXN3-214ENST00000557258 2692 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 RPP25-201ENST00000322177 3049 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 MEGF6-202ENST00000356575 5455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 RNASEH2A-201ENST00000221486 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 FIGNL1-207ENST00000435566 593 ntTSL 4 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 AC099805.1-202ENST00000519927 1057 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 ORAOV1-210ENST00000539414 817 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 ADAM10-217ENST00000561288 583 ntTSL 3 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 COL9A3-201ENST00000343916 2485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 SDR39U1-206ENST00000553930 1325 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 CRLF3-201ENST00000324238 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 MTERF2-202ENST00000392830 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 NAF1-202ENST00000422287 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 BIN2-210ENST00000615107 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 CXorf40B-205ENST00000462691 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 OGFOD3-202ENST00000329197 1652 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 IFRD2-202ENST00000417626 2109 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 KLHL11-201ENST00000319121 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 ADAP1-216ENST00000539900 2178 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 ZNF652-202ENST00000430262 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 KHNYN-206ENST00000556842 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 TCEAL2-202ENST00000372780 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 RPP38-203ENST00000378202 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 TST-204ENST00000622841 1105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 MPZ-206ENST00000533357 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 SMARCD2-203ENST00000448276 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 ZAR1L-202ENST00000533490 1564 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 SEPT2-203ENST00000391971 3315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 VAV1-210ENST00000602142 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 LINC01126-201ENST00000623515 1646 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 PRSS33-201ENST00000293851 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 GNMT-201ENST00000372808 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 COX18-204ENST00000507544 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CDC42EP5Q6NZY7 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.7 ms