Protein–RNA interactions for Protein: Q6NXT2

H3F3C, Histone H3.3C, humanhuman

Predictions only

Length 135 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H3F3CQ6NXT2 MTG1-205ENST00000477902 1283 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 TMEM9B-AS1-201ENST00000525484 1053 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 MRPL52-215ENST00000556840 398 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 AL133352.1-203ENST00000557395 1234 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 CHMP2A-208ENST00000601220 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SPTBN4-202ENST00000352632 8676 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 AP3S1-201ENST00000316788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 VSTM2A-203ENST00000404951 2521 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 UHRF1-203ENST00000615884 2651 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 FAM57A-201ENST00000301324 2013 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 PRELID3A-203ENST00000587735 1694 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 ELMOD1-202ENST00000443271 1990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 AIRE-201ENST00000291582 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 WDR34-201ENST00000372715 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SMPD3-203ENST00000563226 2093 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 ZNF324B-202ENST00000545523 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 AHCYL1-202ENST00000369799 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 FBXO44-201ENST00000251546 1896 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 PGLS-201ENST00000252603 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SPSB3-201ENST00000301717 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 KCTD18-201ENST00000359878 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 LINC00311-201ENST00000366314 1566 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 LAD1-202ENST00000391967 2906 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 CDCA7L-203ENST00000406877 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 MAFF-202ENST00000407965 2325 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 DUSP5P1-201ENST00000441325 1139 ntBASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 ARSI-203ENST00000515301 1429 ntTSL 4 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 TEN1-204ENST00000588202 862 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 AC024563.2-201ENST00000603282 481 ntBASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 KMT5B-201ENST00000304363 5837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SGO1-209ENST00000442720 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 AC013268.5-201ENST00000454928 1959 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SNX4-201ENST00000251775 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 TMPRSS5-201ENST00000299882 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 P3H4-201ENST00000355468 2791 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 GDF7-201ENST00000272224 9749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 MMD2-201ENST00000401401 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 TMEM151A-201ENST00000327259 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 TBPL1-203ENST00000367871 808 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 MRPL2-208ENST00000489623 570 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 TFF3-204ENST00000518498 1109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 AC005332.3-201ENST00000589904 676 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SYBU-201ENST00000276646 2870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 TMC5-203ENST00000396229 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 AC044802.1-201ENST00000501143 2894 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
H3F3CQ6NXT2 SPAG1-206ENST00000520643 1723 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.6 ms