Protein–RNA interactions for Protein: Q6NUK4

REEP3, Receptor expression-enhancing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 255 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
REEP3Q6NUK4 RBCK1-213ENST00000475269 1200 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 METTL23-208ENST00000588822 1049 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 CYGB-204ENST00000589342 815 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 OARD1-202ENST00000424266 1337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 TAP1-201ENST00000354258 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 JAKMIP1-202ENST00000409021 2975 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 UBE2D2-202ENST00000398733 2702 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 CASKIN2-201ENST00000321617 5015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 ISLR2-201ENST00000361742 4817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 GAMT-201ENST00000252288 1121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 MRPL15-201ENST00000260102 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 ZCCHC24-201ENST00000372333 906 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 CERNA3-201ENST00000521403 557 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 BNIP3L-206ENST00000523515 915 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 AC027682.2-201ENST00000563083 336 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 GRAP-204ENST00000573099 846 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 CIRBP-217ENST00000588230 1013 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 AP001412.1-201ENST00000608405 714 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 RUVBL1-202ENST00000464873 2126 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 DHRS2-201ENST00000250383 1705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 SERPINE2-206ENST00000447280 1716 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 RNFT2-204ENST00000407967 2415 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 FAM58A-204ENST00000576892 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 NTRK1-203ENST00000392302 2609 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 NMRK1-203ENST00000376811 2050 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 HOXB6-201ENST00000225648 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 TSSC4-201ENST00000333256 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 MZT1-201ENST00000377818 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 CCDC91-220ENST00000545336 2738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 TMEM132A-201ENST00000005286 3480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 ATP5L-201ENST00000300688 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 PMVK-201ENST00000368467 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 SLC35A2-202ENST00000376512 903 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 TIMM17B-201ENST00000376582 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 ARID3C-201ENST00000378909 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 WDR86-AS1-203ENST00000480632 704 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 SLC26A11-212ENST00000572725 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 B3GALT5-206ENST00000615480 2617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 XKR8-201ENST00000373884 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 CLASRP-203ENST00000391953 1941 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 TMEM263-204ENST00000548125 3349 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 MYO19-225ENST00000621344 1640 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 NPAS1-201ENST00000439365 1341 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 AC012615.6-201ENST00000593201 1697 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 NCOA6-207ENST00000616167 3271 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 FLJ13224-201ENST00000313737 1514 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 ELL2-201ENST00000237853 6046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 DBX1-201ENST00000524983 1380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 AC008687.8-201ENST00000599795 1748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 TOR2A-205ENST00000463577 2211 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 AFG3L1P-203ENST00000418696 2965 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 AC004803.1-203ENST00000539259 501 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 GCHFR-205ENST00000559932 695 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 AC142381.4-202ENST00000563973 229 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 MIR3180-5-201ENST00000583743 153 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 AL024498.1-202ENST00000606652 480 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 KDM1A-202ENST00000400181 3059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 SCARB1-203ENST00000415380 2731 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 AMDHD2-203ENST00000413459 2049 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 GNAS-203ENST00000306120 1878 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 GFY-201ENST00000576655 1876 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 EGFL7-204ENST00000406555 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 C12orf42-205ENST00000548048 1532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 AL355987.4-201ENST00000415992 4244 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 KCNK4-205ENST00000538767 1389 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
REEP3Q6NUK4 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms