Protein–RNA interactions for Protein: Q6KF10

GDF6, Growth/differentiation factor 6, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 455 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GDF6Q6KF10 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 NICN1-204ENST00000436744 1271 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 MARCH9-201ENST00000266643 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 HABP4-201ENST00000375249 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 FBLN1-201ENST00000262722 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 CCDC47-202ENST00000403162 2195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 LRP1-204ENST00000553277 1693 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 BICRA-204ENST00000614245 5697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 ICAM4-202ENST00000380770 1211 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 LDHD-201ENST00000300051 2067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 P2RX5-203ENST00000547178 1998 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 FAM120A-201ENST00000277165 5118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 CWH43-201ENST00000226432 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 BRAF-201ENST00000288602 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 PTGER2-201ENST00000245457 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 HSD17B1-202ENST00000585807 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 MYLKP1-201ENST00000509077 1580 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 GMPR-201ENST00000259727 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 ARHGAP8-201ENST00000336963 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 NFATC4-223ENST00000555802 1476 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 CDO1-201ENST00000250535 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 ZNF346-201ENST00000358149 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 TNNC1-201ENST00000232975 714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 MRPS24-203ENST00000418740 743 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 NCBP2-AS1-201ENST00000447775 562 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 IRF8-202ENST00000562492 946 ntTSL 3 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 SLC9A3R2-208ENST00000566198 1199 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 LAPTM4B-204ENST00000619747 2758 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 TRIP13-201ENST00000166345 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 PSPC1-206ENST00000619300 2013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 ZRSR2-201ENST00000307771 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 LRWD1-201ENST00000292616 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 FGFR2-208ENST00000360144 3001 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 DACH1-201ENST00000611519 4789 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 TRMT2A-203ENST00000404751 2498 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 RBM34-201ENST00000408888 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 FOXD3-AS1-201ENST00000418244 941 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 PMS2P1-201ENST00000431037 1228 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 AC018712.1-201ENST00000455767 687 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 SMIM4-202ENST00000476842 522 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 HEXA-210ENST00000567213 1000 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 MIMT1-202ENST00000599641 1290 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 AL049840.3-201ENST00000602669 611 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 PRR14-203ENST00000542965 2316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 TRIM61-201ENST00000329314 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 LCAT-201ENST00000264005 1507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 SLC25A27-202ENST00000411689 2526 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 AL691447.2-201ENST00000454869 2162 ntTSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 YIF1B-204ENST00000392124 1404 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 VGLL4-210ENST00000426568 1428 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 DGKZ-214ENST00000527911 3337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 AC112777.1-201ENST00000540175 1423 ntBASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 IMPDH1-214ENST00000496200 2283 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 FAM43B-201ENST00000332947 2572 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
GDF6Q6KF10 KLC2-204ENST00000394067 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.9 ms