Protein–RNA interactions for Protein: Q6JVE6

LCN10, Epididymal-specific lipocalin-10, humanhuman

Predictions only

Length 187 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LCN10Q6JVE6 SIDT2-217ENST00000532062 2143 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 PDCD10-201ENST00000392750 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 CCT5-214ENST00000515676 1997 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 TMEM234-202ENST00000344461 721 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 AL845331.1-201ENST00000424978 1190 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 IP6K1-204ENST00000468463 1815 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 NKX2-1-202ENST00000498187 2338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 COL4A3BP-201ENST00000261415 2262 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 SLC35B2-207ENST00000619636 2063 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 TRIM7-205ENST00000422067 1954 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 BTG3-201ENST00000339775 1485 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 STX11-201ENST00000367568 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 FOXP4-205ENST00000409208 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 SLC25A20-201ENST00000319017 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 ERCC2-203ENST00000391944 2334 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 SLC6A11-202ENST00000454147 2794 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 LTBP4-201ENST00000204005 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 ZDHHC3-205ENST00000424952 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 REEP2-202ENST00000378339 2170 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 EMC9-202ENST00000419198 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 CNEP1R1-203ENST00000458059 2965 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 RNPS1-224ENST00000569598 918 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 AL513523.2-201ENST00000633218 660 ntTSL 3 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 SHROOM1-202ENST00000378676 2352 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 ACBD4-207ENST00000586346 1579 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 NYX-202ENST00000378220 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 UTP18-201ENST00000225298 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 ESPN-205ENST00000461727 1869 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 AL499627.1-201ENST00000569373 2188 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 FOXC1-201ENST00000380874 3926 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 IRGC-201ENST00000244314 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 VBP1-201ENST00000286428 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 SLC2A14-214ENST00000542505 1650 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 ATRN-201ENST00000262919 8633 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 UXT-201ENST00000333119 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 CORT-201ENST00000377049 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 AC246785.2-201ENST00000432512 513 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 PHGR1-201ENST00000448599 436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 BOC-211ENST00000484034 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 AC073111.4-202ENST00000486297 585 ntTSL 4 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 FOSL1P1-201ENST00000511041 816 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 SNHG15-203ENST00000578968 982 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 AC008738.3-201ENST00000589932 659 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 H2BFWT-202ENST00000611083 528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 FAR2P2-204ENST00000424873 2070 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 ACVR1B-205ENST00000541224 1791 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 MARK2-208ENST00000508192 2924 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 YY1AP1-213ENST00000405763 2011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 TBX21-201ENST00000177694 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 FBXO24-201ENST00000241071 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 PGS1-201ENST00000262764 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 CORO1B-202ENST00000393893 1931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 HSD3B7-202ENST00000297679 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 SET-201ENST00000322030 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 GCOM1-202ENST00000380569 1846 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
LCN10Q6JVE6 UBE2J2-205ENST00000400930 1021 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.8 ms